第二阶段计划从2008年6月12日-2009月5月进行，主要内容如下：
1．2008年6月12日-8月15日前完成修建机耕道路21.45km，由木垒县绿河建筑安装有限责任公司承建，施工单位负责人骆天孝；建设方负责人为县农发办主任张健。
2．2008年8月15日-8月30日，组织项目区农民对项目区内的原矩形渠道的砼板进行拆除，由农民投工投劳完成。具体责任人为新户乡乡长王集标。
3．2008年8月15日-11月20日，开始改建防渗渠道10.27公里，并完成渠道配套的桥涵闸。共分为三个标段：一标段6.07公里“U73型”防渗斗渠和0.4公里“U80型”防渗支渠由木垒县绿河建筑安装有限责任公司承建，施工单位负责人骆天孝；业主负责人为王集标、张健。二标段2公里“U73型”防渗斗渠由木垒县绿河建筑安装有限责任公司承建，施工单位负责人杨恒云；业主负责人为王集标、张健。三标段6.2公里“U73型”防渗斗渠0.38公里“U80型”防渗支渠由新疆泰治建设工程有限责任公司承建，施工单位负责人韩建国；业主负责人为王集标、张健。渠道建成后分阶段投入运行，以保证渠道施工不影响农作物的正常灌溉。此项工作由县农发办和新户乡人民政府负责。
4．2008年9月15日-9月30日，组织项目区农民对项目区的全部树田进行修整，并对树干涂刷石灰。此项工作由农民投工投劳完成。具体责任人为王集标。
5．2008年9月底10月初，完成土地平整0.03万亩。具体责任人为王集标。
6．2008年秋季根据新沟村的实际情况，引进高产优质的冬小麦、玉米品种，推广地膜鹰嘴豆种植等农业科技措施，以提高项目区农民的收入。项目区农民将预留3000亩科技示范田，进行新技术、新品种的引进和试种。具体责任人为王集标。
7．2008年11月-2009年3月，利用科技之冬活动，对项目区农民进行科技培训。此项工作由新户乡人民政府负责协调和组织。
8．2009年3月25日起，组织项目区农民对项目区的防护林带进行全面的补栽、修整（农民投工投劳）。具体责任人为新户乡人民政府。
9．2009年5月，对项目区水利、农业、林业和科技措施进行彻底的自检，发现问题及时解决，做好迎接上级检查验收的各项前期准备工作。
三、几点要求
1．农业开发项目实施过程中，实行责任追究制度，参与农业开发的项目管理、资金管理、建设、监理部门应严格执行国家农业开发政策和工作规定，任何人不得在项目实施过程中违反规定变更设计、降低质量、挪用资金，由于违反国家农业开发规定造成严重后果的，对直接责任人员要移交有关部门追究行政、法律责任。
