包括企业技术开发机构资助资金、高新技术成果转化项目贷款贴息、科技型中小企业贷款担保代偿资金、软件产业资助资金、生物医药设备共享资助资金、新药开发资助资金。
（三）合作与配套类
包括科技项目配套资助资金、中国科学院与浦东新区种子资金、国防科技工业项目合作与奖励资金。
（四） 其他类
包括科技基金管理办公室经费及科技基金管理费、经理事会批准的其他专项资金。
第五条 （管理机构及其职责）
科技基金管理机构由理事会、管理办公室和操作部门组成。
科技基金理事会由区政府及有关部门领导组成，负责起草科技基金管理办法和审定各专项资金操作细则；负责安排科技基金年度支出计划；确定各专项资金的额度、科技基金支持的产业方向和重点项目，决定重要事项，并对科技基金运作进行指导和监督。
科技发展基金管理办公室（以下简称“基金办”）是科技基金理事会常设办事机构，负责编制科技基金年度预算和决算；负责日常管理工作，定期向科技基金理事会汇报资金拨付和科技基金运作情况；监督项目的实施；主持科技基金资助项目的验收。
操作部门是指本办法第四条所列专项资金的具体操作机构，负责起草项目指南，跟踪项目实施进度，做好专项资金需求年度预测和工作总结，负责项目材料的完整性并及时归档。
科技基金账户设在新区财政局。
第六条 （项目审批权限及原则）
科技基金理事会负责审批风险投资资金、企业技术开发机构资助资金。其他各专项资金由科技基金理事会授权区政府相关职能部门审批，单一项目超过80万元或突破专项资金操作细则中资助上限的项目，由科技基金理事会审批。
科技基金理事会审批项目实行少数服从多数的原则。
第七条 （申请及拨付程序）
基金办统一发布各专项资金项目指南和受理通知。申报单位按申请条件向各专项资金操作部门提供相应的申请材料。
操作部门按本办法及各专项资金操作细则的规定进行初审，对申请评审类项目组织专家评审或委托评估，根据初审情况和评审或评估结果拟定报批方案，向基金办报送科技基金拨款审批单，并附项目材料。
基金办复核后负责报送科技基金理事会审批，或报送科技基金理事会授权的有关职能部门审批。项目经批准后，基金办将有关材料送新区财政局，新区财政局据此拨款。
