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（四）规划基建科
负责拟订交通基础设施建设的发展规划、中长期发展计划和年度计划；负责交通行业的统计、预测和信息引导工作；负责组织编报行业各种统计报表和交通年鉴编制；组织有关交通基础设施建设项目、公路（桥梁、隧道及渡口）收费立项、可行性研究报告的审查和管理；负责交通建设市场的监督调控、资质审查和管理，维护交通建设市场的平等竞争秩序；负责交通建设工程的招投标、质量监督和造价管理；组织交通基础设施的建设和评审工作；负责公路规划、建设和养护管理；负责公路路政管理，维护公路建设与养护的正常运营秩序；负责交通基础设施建设的安全生产管理。
（五）道路运输管理科
负责道路运输的行业管理，维护道路运输行业平等竞争秩序；拟订道路运输政策法规的实施办法；协助编制道路运输的发展规划和年度计划；拟定道路客货运输站（场）建设计划；负责组织征收道路运输管理费并提出使用意见；负责营业性道路客货运输、道路运输站（场）、营业性机动车维修、机动车驾驶员培训的行业管理；负责道路运输市场的运力规划投放、线路牌证发放和运政执法监督；负责出租车、旅游客车运输管理；组织实施道路重点物资、军事和紧急客货运输；协助培训道路运政执法人员，实施对下一级道路运输管理机构工作的指导监督；负责道路运输安全生产管理；协助组织道路运输的反走私工作；对市道路运输协会进行业务指导。
（六）港口航运管理科
负责水路运政管理、港口码头行政管理，维护水路运输、港口码头行业平等竞争秩序；拟订水路运输政策法规的实施办法；协助编制水路运输的发展规划和年度计划；负责水路运输市场的运力投放和运政执法；负责水路运输及水路运输服务业、运输船舶代理、船舶修造的行业管理；负责港口码头公共基础设施监督管理，港口码头规划及建设项目的审核，港口码头岸线使用的审批、外轮理货、引航及港口辅助业的行业管理；负责组织协调和实施水路重点物资、军事、防洪抢险紧急客货运输；协助培训水路运政执法人员；协助组织水路运输的反走私工作；监督水路运输、港口码头安全生产管理；组织水路运输管理费、港口管理费的征收和管理。
（七）安全法制科
组织制定交通行业安全生产工作规划和规章制度并监督实施，指导、协调交通行业的安全生产工作；参与组织重大安全事故的调查和处理，协调、组织行业安全生产专项检查；负责拟订交通行业科技发展规划和计划并指导实施；组织科技成果鉴定和推广应用；指导、监督包括交通环保、技术专利、质量工作在内的交通行业技术标准和规范的实施；负责指导交通行业体制改革及提供相关的法律依据；负责局机关及指导交通行业的法制工作；负责政策法规宣传和开展法制教育工作；负责交通行政复议和执法监督工作；承办局机关的行政诉讼案件。
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