1、个别医疗单位对传染病防治工作没有引起高度重视，重医疗、轻预防，重经济效益、轻社会效益，对传染病防治工作存在应付思想，缺乏开展传染病防治工作的自觉性。没有按照传染病防治法律法规的要求，开展医护人员传染病防治法律法规以及防治知识的全员培训。门诊医务人员传染病诊断标准模糊，尤其对其他感染性腹泻诊断标准不掌握，几乎所有腹泻病均诊断为肠炎，有的乡镇卫生院全年无其他感染性腹泻病例报告。
2、部分乡镇卫生院传染病防治相关制度不规范，措施落实不到位。疫情报告、奖惩等制度流于形式，传染病报告无制约措施。有关传染病防治的文件、传染病工作制度等材料整理归档工作是个薄弱环节。
3、部分乡镇卫生院网络直报设备落后，有的无专用微机，不能保证每天及时录入传染病报告卡。网络直报人员培训不到位，业务不熟练，不能胜任传染病疫情网络直报的职责，其中高青县木李镇卫生院全年无传染病疫情报告。
4、部分临床医生传染病报告卡诊断日期填写不全，由网络直报人员随意填写，造成诊断日期与报卡日期逻辑不符。
5、大部分社区卫生服务中心（站）、村卫生室没有门诊登记日志，医务人员传染病诊断水平普遍较低，责任意识不强，不能充分发挥传染病防控前沿阵地的作用。
6、大部分乡镇卫生院由于人员、房屋所限，传染病分诊点设置不够合理，功能分区不全，接诊流程不规范，分诊隔离防护制度形同虚设。感染性疾病病人在普通门诊就诊，存在医院内感染隐患，并且可能导致漏报、迟报。
7、部分乡镇卫生院突发公共卫生事件应急物资未实行集中归类管理，常见传染病检测试剂储备品种不全，药品防护物资不同程度存在过期和数量不足现象，不能满足突发事件应急需要。
三、基层传染病防治工作措施
1、各区县卫生局要高度重视二级以下医疗机构传染病防控工作，切实落实各项防控措施，依法监督各医疗机构建立健全各项传染病防治工作制度，提高传染病防治及疫情网络直报质量和水平，充分发挥传染病防控前沿阵地的作用。
2、各医疗机构要充分认识自己在传染病防治工作中的法定职责，强化医院内部传染病防控工作的管理、督导，加强医院内部管理，建立健全各项规章制度，制定具有执行力、操作性强的传染病防治相关规章、制度和工作流程。
3、乡镇卫生院按照《
传染病防治法》和《
医疗机构传染病预检分诊管理办法》的规定，进一步加强传染病分诊点的建设工作，做到规范建设、设置合理、功能齐全。真正落实预检分诊制度，进一步作好发热病人、肠道传染病等病人的预检分诊工作，切实发挥传染病分诊点在医院传染病防治工作中的作用。乡镇医院内部要加强传染病防治、网络直报知识的培训工作，加强传染病诊断知识的学习，严格落实医生首诊负责制，提高医务人员依法进行传染病诊疗工作的自觉性。网络直报人员定期核对门诊日志，做好网络直报自查工作，并做好记录，尤其加强对检验科细菌学和血清学登记本的检查工作，及时与门诊日志核对，避免传染病漏报。
