结算中心对系统应用软件进行修改，须经人行深圳市中心支行同意，并提前书面通知各参与行。
第十九条 支付信息在参与行前置机的联机储存期限由各参与行自行设定，但不得少于30天；在处理中心主机的联机储存期限为30天。
各参与行和结算中心应对数据作日终脱机备份。脱机备份数据的保存期限按照《会计档案管理办法》规定的同类会计档案的保存期限执行。
第三章 系统业务处理
第二十条 系统运行工作日为国家法定工作日。遇香港或国内公众节假日、香港悬挂八号台风或黑色暴雨警告信号、深圳悬挂四号台风或蓝色暴雨预警信号，深港支付业务停止运行。
遇特殊情况，经人行深圳市中心支行批准，结算中心可调整系统运行工作日，但应提前书面通知各系统参与者。
第二十一条 系统运行时间
（一）营业窗口时间：同城支付业务营业窗口时间为8：00-16：30；深港支付业务营业窗口时间为9：00-15：00。在此期间，参与行可发起正常的支付业务。
（二）清算窗口时间：16：30一17：00。在此期间，参与行不能发起正常的支付业务，但可调拨资金用以弥补清算帐户头寸不足，清算已作排队处理的支付指令。
（三）日终处理时间：17：00～
参与行必须按系统运行时间发送或接收电子支付指令。
遇特殊情况，经人行深圳市中心支行批准，结算中心可调整系统运行时间，但应及时通知各系统参与者。
第二十二条 同城支付业务的处理
（一）发起行和提出行的处理
发起行受理发起人提交的同城支付业务并审查无误后，应按规定格式将原始凭证经录入、复核、授权转换为系统处理的电子支付指令，经提出行及时发送处理中心。发起行在原始凭证加盖“实时支付”戳记。
在清算帐户余额不足的情况下，由处理中心对支付业务作排队处理，提出行可以调整排队队列的顺序，但通过系统处理的净额支付系统（如外币票据交换系统、深港银行卡联网系统等）清算差额支付指令优先其他支付指令进行清算，不得调整队列顺序。
在清算窗口时间内，清算帐户余额不足的提出行应及时筹措资金，补足头寸，确保清算。
