农村工作部门：把初级卫生保健工作列入农村现代化建设的重要内容，配合做好农村改水、改厕和合作医疗的实施，加强对人畜共患病的预防控制，组织开展卫生扶贫。
卫生部门：做好初级卫生保健工作的综合管理、业务指导和质量监督；加强农村卫生网络建设和新型合作医疗制度的建设，发挥中医药的优势和作用，落实农村公共卫生和基本医疗保健服务，提高卫生服务质量和服务效率。
爱国卫生运动委员会：加强农村改水、改厕的规划、实施，组织新技术的交流、推广，开展农村环境卫生整治与监督指导。
环境保护部门：加强对农村环境污染的监测、监督，严格监控污染物的排放，加强对饮用水源的监督管理，推进农村环境综合整治，努力提高农村环境质量。
水利部门：结合农村水利建设，配合做好农村改水和血防灭螺工作。
乡镇企业管理部门：督促乡、村企业加强劳动保护设施建设，控制和消除职业危害因素，降低职业病的发病率。
教育部门：结合成人扫盲进行卫生常识教育；按照《
学校卫生工作条例》要求配备健康教育师资，并将健康教育纳入中、小学教学大纲和教学计划，健康教育每学期不少于10课时；搞好学校卫生，改善食堂卫生及其他卫生条件。
文化、广播电视、新闻部门：加强对初级卫生保健的宣传和报道，传播卫生知识，提高农村居民的自我保健能力，宣传和引导全社会支持、参与农村初级卫生保健。
民政、人事、劳动保障、建设、药品监管、盐业管理、计划生育等部门也要根据职责，落实相关措施，支持农村初级卫生保健工作。
㈢深化卫生改革。深化卫生院内部改革，形成有生机活力的用人机制和分配激励机制，提高服务效率。完善县、乡卫生机构的功能、布局，重点加强县级预防保健机构和农村中心、乡镇卫生院的建设，提高技术队伍素质，保证开展公共卫生和基本医疗服务的基础设施和条件。到2010年基本完成县级医院、预防保健机构和中心、乡镇卫生院的建设改造任务，达到基本设施配置标准。
㈣加强公共卫生建设。贯彻预防为主方针，实施农村公共卫生基本项目规划，全面落实农村公共卫生各项任务。积极防治、控制严重危害农民健康的传染病、地方病、职业病，巩固、提高计划免疫接种率，继续搞好食盐加碘、地氟病区的改水、改灶和血吸虫病疫区灭螺工作，开展慢性非传染性疾病的防治。健全农村妇幼保健网络，加强孕产妇和儿童系统管理，保证乡镇卫生院具备处理孕产妇顺产的能力、县级医疗保健机构和中心卫生院处理孕产妇难产的能力，进一步降低孕产妇死亡率、婴幼儿死亡率和出生缺陷发生率。加强农村环境卫生整治，促进卫生县城和卫生村、镇建设。结合农村沼气生态农业建设、水利设施建设和小城镇建设，引导和组织农民改水、改厕，提高农村自来水、卫生厕所和沼气的普及率。积极开展健康教育，推进“全国亿万农民健康促进行动”。加大对农村医药卫生执法监督力度，加强食品卫生、职业病防治、医疗服务市场、药品及其它健康相关产品的监管。
