乡镇动物防疫站实行县乡共管、以县为主的管理体制。人员结构要按照事业单位人事制度改革的要求按需设岗。其人员从原乡镇畜牧兽医站人员中竞聘上岗，不足的面向社会公开招聘。乡镇动物防疫人员的聘用条件由市畜牧水产行政主管部门制定，县级政府人事部门会同畜牧水产行政主管部门按照公开、公平、公正的原则，通过考试考核，择优聘用。所聘人员实行人事代理。对乡镇畜牧兽医（水产）站原有在编、现已退休或分流人员要按照国家有关政策规定给予妥善安置。
（三）逐步完善经费保障机制。动物防疫是社会公益性事业，是政府行为，要按照分级负责的原则，逐步建立和完善动物防疫经费保障机制。
1、市、县动物防疫监督站编内人员的工资和必要的工作经费要全额列入同级财政预算；乡镇动物防疫站（畜牧水产站）专职防疫员的工资及社会养老保险、医疗保险中应由单位缴费的部分和工作经费纳入县级财政全额预算，岳阳楼、君山区4个乡镇办事处的动物防疫人员经费补助由市区财政按照省财政有关规定负责落实。
乡镇动物防疫站（畜牧水产站）从事动物防疫等工作，按国家规定收取的费用按收支两条线管理，全部上交县级财政，全额用于动物防疫事业。
2、防治牲畜口蹄疫、禽流感等重大动物疫病所需疫苗和扑杀病畜补助经费要按上级要求足额配套到位，列入市、县财政预算。
3、建立重大动物疫病储备基金。市、县分别按畜牧业产值的0.1%和0.5%的比例逐步建立重大动物疫病储备基金。将扑灭重大动物疫病所需经费和防疫物资储备等纳入国民经济发展计划和财政预算，并由市、县财政设立专户储存。一旦发生重大畜禽疫病，立即启用储备基金，迅速控制扑灭疫情，减少疫情危害。
4、逐步完善基础设施建设。按照国家关于动物防疫基础设施建设标准，逐步配套完善市级畜禽水产品质量检验检测中心；建立健全县级疫病诊断化验室，更新完善乡镇站冷链体系。同时，计划用2年左右时间，建立市、县、乡三级疫情信息网络体系，实现三级联网；充实监督执法设备，全面提高我市动物疫病预防和应急反应能力。
三、强化动物防疫工作的责任制和责任追究制
动物防疫工作是各级政府的重要职责，各级政府主要负责人是动物防疫工作的第一责任人。要建立各级政府主要领导负总责、分管领导具体抓的领导机制和有关部门分工协作、全社会积极参与的工作机制。要将重大动物疫病的免疫密度、动物检疫率、染疫畜禽扑杀率和疫病控制纳入各级政府年度和任期目标责任制。对于动物防疫问题长期得不到解决，防疫措施不落实而发生疫情或引起扩散蔓延的，要从严追究相关人员的行政责任。
畜牧水产、计划、财政、公安、工商、卫生、交通等相关部门要在各级人民政府的统一领导下，各负其责，各司其职，密切配合，责任到人，确保每个环节、每项措施落到实处。
