（1）县级医院。2010年，县医院继续实施按项目收费，业务总收入不得超过其2009年收入额的105%；建立国际标准成本核算体系，测算DRGs支付标准。2011年，实施国际标准的诊断相关组（DRGs） 预付制度，各种不同种类的保险均按DRGs预付支付方式和标准支付县医院。
　　（2）乡镇卫生院。乡镇卫生院公共卫生补助经费按服务人数包干，并按绩效考核付费；门诊医疗费用按人均1.5次服务量，次均费24元包干，并按绩效考核付费。2011年将根据不同的人口构成、疾病发生情况等因素，对公共卫生补助经费进行风险调节。
　　经费计算方法。公共卫生部分：8元乘以乡镇人口总数；门诊医疗服务：以次均费24元， 人均在乡镇卫生院就诊1.5次乘以全乡镇人口，预算总额为上述3个要素计算。
　　支付方式。将两者捆绑整合，乡镇卫生院在每年期初可以得到60%-70%的预算。最终实际付费将根据对乡镇卫生院的绩效考核成绩进行奖励或处罚。
　　服务支付方式。2010年，仍将采用按服务项目付费方式。住院收入上限以2009年住院收入为基准。2011年，住院部分纳入预付制。
　　对乡镇卫生院的绩效考核将包括对村卫生室的监管，如果村医的绩效不达标，乡镇卫生院负有同样责任。绩效考核由县卫生局和相应的管理委员会实施。这一委员会成员应包含新农合、公共卫生管理部门和病人（具体方案待细化）。
　　乡镇卫生院的结余，由其自主安排使用。
　　（3）村卫生室。收入来源包括：每月100元的政府补贴；公共卫生补助费，每个服务对象可获得7元的公共卫生补助经费，总预算为7元乘以村人口数；基本医疗服务费，以次均门诊费13元，人均村卫生室就诊1.5次乘以村人口数，总预算额为上述3个要素计算；村卫生室每提供1次门诊服务，可以得到2元的诊疗费，病人和新农合各出1元；每提供1次出诊服务，可获得4元的诊疗费，病人和新农合各出2元。
　　村卫生室支付方式。每季度初乡镇卫生院给村卫生室预拨预算总额的60%-70%，余下的依绩效考核结果定，每月村医报账时，新农合支付其当月的诊疗费。
　　村卫生室的考核。公共卫生绩效考核：在现有的考核内容上增加结核病管理、结核病早期发现和转诊、高血压病管理、高血压病人的血压控制（具体方案待细化）。基本医疗服务考核：包括处方记录保存、常见病诊疗规范性、合理使用抗生素、肌肉注射和静脉滴注的适宜性、次均费用控制、门诊服务量至少达到人均1.5次、出诊服务必要性、合理性、病人满意度（诊所开放时间、交通情况；每次就诊所费时间；为病人解释健康问题等）。
　　（4）实行乡村一体化管理。村卫生室的政府补贴、公共卫生补助经费、基本医疗门诊预拨款先拨至乡镇卫生院，由卫生院按季度预拨70%，其余的30%经绩效考核后发。如有结余，按照乡镇卫生院与村卫生室事先协商签订的协议进行二次分配。乡镇卫生院和村卫生室共同承担的门诊服务量不低于人均3次，其中50%的服务必须在村级提供。如果村卫生室服务能力过于低下，乡镇卫生院可以直接派人在村级设卫生站提供服务。

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