（二）种子繁育体系功能弱化，主要农作物优良种子更新更换不快，现有当家品种提纯复壮跟不上。一是由于大宗农作物种子难以推陈出新，提纯复壮又未跟上，因而出现退化、种子混杂，同一块田内同一品种“几层楼”的现象。不少蔬菜品种也出现果型愈来愈小，病虫灾愈来愈重，单产愈来愈低，品质愈来愈差的趋势。二是新的农作物种子无论粮油和蔬莱，单产和品质都很难有新的突破，科技含量较高、有希望实现新突破的杂交组合还没有。即使花了较大的代价引进的杂交组合，也由于消费、吸收和创新没有跟上，仍然难以育出适合本市需要的、优良的、可以进人二十一世纪的新品种。粮油、果蔬、花卉年年花较多的外汇向发达国家引种的状况尚未摆脱。
（三）国务院颁布的《
种子管理条例》等法规没有落到实处，有法不依，执法不严的状况相当突出。一是盲目引种，个别地方引进的种子未经试种，也未经办理检疫等相应手续，不仅影响自身产量的提高，而且还带进了本市没有发生过的病虫害；二是产种重复，由于种子生产计划管理不严，随意繁殖，出现低水平重复，种子转商率较高；三是经营无序，在种子经营上存在着比较严重的“一多二乱”现象，尤其是对有利可图的蔬菜、花卉、苗木，全市种子经营单位有上千家，其中有不少是无证经营，致使假冒伪劣种子充斥市场，每年都有一定数量的生产者受骗上当，严重影响农业生产，损害农民利益。
二、加快建设适合市场经济运行的种子新体系
为了加强种子工作，积极推进种子产业化，必须改革本市种子体系现行的运行机制，建立新的适应“两个根本性转变”的运行机制。总的思路是建立种子“223”的运行机制，即实行两种机制分开（把行政管理机构和经营、技术机构分开设立，把大面积的粮食常规种子同其它种子分开区别对待），完善两项政策保障（保障种子管理机构和良种繁育、推广所需的经费，保障粮食常规种子经营的政策补贴和优惠），加强3个重点建设（种子基地建设，粳型杂交稻种子制种、繁殖、加工、统供一条龙产业建设，制种依法管理的建设）。
（一）健全制种管理体系。把市、县（区）两级种子管理和执法职能从现有“三位一体”的机构体制中分离出来，形成独立的种子管理机构。即市的种子管理总站和县（区）的种子管理站，仍为事业单位。编制数：市总站9-11人，县（区）站7-9人。其主要职能是：品种的试验、审定和鉴定；种子市场“三证”（生产许可证、经营许可证、质量合格证）的全面管理；种子质量的抽检、认证；种子余缺的调剂平衡；救灾备荒种子的储备管理；种子信息的收集、传递和种子政策的调研拟订等。种子管理机构的隶属关系，由市、县（区）农业行政主管部门根据实际情况确定。其经费由市、县（区）财政分别承担，并随着管理的加强和物价的上涨，按实际需要增拨经费。同时尽快制定《上海市实施＜种子管理条例＞若干具体规定》。
