市委党校（市行政学院）
市委党史研究室
市总工会
共青团惠州市委员会
市妇女联合会
市归国华侨联合会
市工商业联合会
市文学艺术界联合会
市社会科学界联合会
市国际贸易促进委员会
市民族宗教事务局
市老龄工作委员会办公室
市科学技术协会
二、执法部门（58个）市政府办公室
市监察局
市民政局
市财政局
市人事局（市编制委员会）
市国土资源局
市国有资产监督管理委员会
市发展和改革局（市粮食局）
市经济贸易局
市安全生产监督管理局
市教育局
市科学技术局（市知识产权局）
市中级人民法院
市人民检察院
市委政法委员会
市公安局
市公安局交通警察支队
市司法局
市交通局
市信息产业局
市劳动和社会保障局
市规划建设局
市水利局
市农业局
市对外贸易经济合作局
市文化广电新闻出版局
市卫生局
市人口和计划生育局
市审计局
市环境保护局
市统计局
市物价局
市林业局
市海洋与渔业局
市法制局
市口岸局
市打击走私综合治理办公室
市城市管理办公室（市城监支队）
市人民防空办公室
市仲裁委员会
市房产管理局
市市容环境卫生管理局
市公路管理局
市港务管理局
市卫生监督所
市工商局
市国家税务局
市地方税务局
惠州出入境检验检疫局
惠州海关
市质量技术监督局
市食品药品监督管理局
市公安消防局
市烟草专卖局
惠州盐业总公司
东江航道局
惠州海事局
中国银监会惠州银监分局
三、“窗口”服务单位（46个）
市体育局
市旅游局
市外事侨务局
市信访局
市投资服务中心
市中小企业局
市爱国卫生运动委员会办公室
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