我区农畜产品加工企业的发展一定程度上解决了传统农产品的销售和转化问题，但由于技术落后、人才缺乏，生产方式多处于传统手工或家庭作坊阶段及初级加工层次，科技含量不高，缺乏新产品的自主研发能力，新工艺、新技术、新材料的应用程度低，加工标准和质量控制技术不健全；农牧业生产结构与加工需求矛盾突出，生产与加工环节脱节。提高农畜产品加工的自主创新能力，提升农产品精深加工水平，促进农畜产品加工业的持续发展，是当前我区农畜产品加工业科技创新、打造品牌面临的重大挑战。
二、指导思想和发展目标
（一）指导思想
坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，贯彻落实科学发展观，认真贯彻党的十六届六中全会、自治区第七次党代会和全区科技大会精神，围绕发展现代农业和建设社会主义新农村的重大战略需求，围绕“改善农牧民生产生活条件，增加农牧民收入”的首要任务，坚持“用现代工业的理念经营现代农牧业，用产业开发的理念搞活农牧区经济，用以人为本的理念推进农牧民增收”的思路，全面实施科教兴农和人才强农战略，坚持“引创结合、重点突破、夯实基础、支撑发展”方针，提高现代农业物资装备水平，提高农牧业经济增长中的科技含量和科技贡献率，强化建设现代农业科技，推进农牧业科技发展新跨越，为实现全面建设小康社会目标、构建社会主义和谐西藏提供强有力的科技支撑。
（二）基本原则
1．突出重点与整体推进相结合的原则
既要针对资源优势，瞄准重点领域和技术，集中资金、人才等各方面的力量，组织攻关，尽快实现重点突破；又要为全区“一产上水平”，加快传统农牧业向现代农牧业转变，推进优质、高产、高效、生态、安全、标准化进程，发挥科技支撑作用，提高综合生产能力。
2．引进与创新相结合的原则
坚持引进立足于急需、适用、先进，创新立足于特色、优势、重点的原则。推广、生产单位要引进国内外、区内科研、教学单位的新品种、新技术；科研、教学单位要立足区内特色农牧业加快原始创新，加强国内外新技术、新品种、新方法、新设备的引进、消化吸收再创新，提高我区自主创新能力；企业要引创并举，引创结合，研制出具有自主知识产权的产品，提高市场竞争力。
3．现代技术与传统技术相结合的原则
我区正处于传统农牧业向现代农牧业转变的关键时期，现代科技正迅速向农牧业生产、加工等领域渗透。要加快转变进程和步伐，必须实现传统技术与现代农牧业技术的有机结合，在依靠现代农牧业技术提升传统技术的同时，充分发挥传统农牧业技术作用。
4．立足当前与着眼未来相结合的原则
农牧业科技既要突出针对性、实用性，立足实际，解决当前生产中的热点、重点和难点问题，又要体现前瞻性，解决未来带有全局性、战略性的生产和自身发展问题，加强农牧业科技创新和成果储备，实现农牧业增效、农牧民增收和农牧业可持续发展。
（三）发展目标
“十一五”时期，我区农牧业科技工作的主要任务是：实现农牧业由注重产品数量增长，向数量、质量和效益增长并重转变；由注重产前、产中技术，向产前、产中、产后生产全程技术并重转变；由常规种养业单项服务向为特色农牧业产业化发展提供全程服务转变；由以资源开发技术为主，向资源开发和市场开发技术相结合转变。
力争“十一五”末，农牧业科技贡献率达到40%以上；科技普及率达到80%以上；引进、集成和创新成果5项以上；选育农作物新品种5个，优质饲草品种3～6个，改良畜禽品种2～3个；转化农牧科技成果10项以上，示范推广农牧业新技术10项以上；农作物良种覆盖率达到90%以上；完成25个粮食主产区的测土配方施肥技术推广；主要家畜禽良种覆盖率达到25%，重大动物疫病得到有效控制；推广农村沼气20万户；培养有文化、懂技术、会经营的新型农牧民25万人（次），实用技术普及培训150万人（次）以上。
三、农牧业科技工作重点
