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（3）中南部秦淮河流域低山丘陵生态区。该区丘陵地区分布有较为丰富的森林植被，众多山区水库是广大农村的水源。重点解决水土流失和农业面源污染，以及部分地区露天采矿造成的景观破坏。包括两个亚区：秦淮河下游城镇及农业生态亚区，加强新城建设，发展无公害生态农业，控制农业面源污染；秦淮河上游农业生态亚区，发展生态农业和生态旅游，保护森林植被和水源涵养区。
（4）南部石臼湖-固城湖滨湖平原与岗地生态区。该区拥有南京两处最大的湖泊湿地：石臼湖和固城湖，是重要的农产品、水产品供应基地。重点解决洪涝灾害问题。包括两个亚区：石臼湖农业、渔业生态亚区，固城湖农业、渔业生态亚区。发展以无公害粮食、蔬菜种植和水面养殖为主体的生态农业，控制农业面源污染，保护森林植被。
2、构建生态用地格局。
（1）构筑“四横两纵”生态网架。应对南京城市与产业空间的新一轮扩展，着眼于区域生态安全，规划建设六条生态走廊，形成“四横两纵”生态网架。包括，老山-滁河东西向廊道、长江水生态廊道、云台山-青龙山东西向廊道、横山-双尖山东西向廊道、八百河、皂河-付家壇林场南北向廊道、三桥连结线-固城湖岸线南北向廊道。该网架控制长度约600公里，是南京市域范围内需要优先保护、限制开发的地区。该生态网架实现以下功能：一是，形成整体化生态网架。在市域内形成网架状、整体化生态贯通，为整体生态环境保护奠定基础。二是，引导和界定产业发展轴。从东西方向、南北方位为两大产业发展轴提供适度的生态空间和有效的服务功能，确保主城的生态安全和产业轴的生态隔离。三是，实现北部原生态地区的保育。控制六合雄州以北自然生态，有序引导发展生态农业和生态旅游。四是，实现向市域外大生态系统的贯通。从东、南、西、北四个方向分别连通镇江宝华山、浙西天目山、皖南丘陵及江淮丘陵的大面积生态用地，对南京都市圈以及长江三角洲大尺度区域生态环境的稳定与提升起重要的集聚与辐射作用。
（2）保护“一核六片”生态源区。基于宏观生态网架，对于生态走廊相交的节点地区，以及走廊附近具有保存乡土物种、涵养水源、保护自然和人文景观等重要生态服务功能的地区确定为生态源区，属禁止开发区。它同时具有保护水系、利于关键物种迁移的功能。规划保护“一核六片”生态源区：绿心-紫金山。紫金山生态源区面积约35平方公里，包括钟山南麓、北麓及其余脉富贵山、九华山、鸡笼山和玄武湖，其中森林面积约23平方公里，是南京城区最重要的自然植被集中分布区，发挥调节城市环境、保护森林生态系统景观与生物多样性的城市森林功能；北片-芝麻岭。芝麻岭生态源区森林面积约12平方公里，位于南京市域西北角六合区境内。该区远离城市，受开发干扰影响小，是植物和动物资源比较丰富的区域，发挥珍稀物种保护、生态研究基地、背景生态环境的作用；西片-老山。老山生态源区总面积约80平方公里，位于长江北岸与滁河之间。老山植被类型属落叶阔叶与常绿阔叶混交林，动植物资源极为丰富，是秤锤树、青檀、獐、灵猫等珍稀动植物的栖息地，具有生物多样性保护和清洁大气源区的重要生态功能；东片-青龙山、大连山。青龙山-大连山生态源区森林面积约36平方公里，位于南京城东南10公里，江宁区境内。平行排列、呈东北-西南走向的青龙山、大连山区覆盖的森林植被，是南京都市发展区内重要的自然景观保护区。规划建设珍稀濒危植物迁地保护景观区，重点保护和展示秤锤树、尾叶樱、南京柳、蒙桑、南京椴，以及宝华玉兰，梭罗树等；南片-云台山。云台山生态源区由分别位于江宁区南部的南山、云台山和横山森林斑块构成，总面积约70平方公里。该区域野生植物资源丰富，是生物多样性及重要森林生态景观保护区。东南片-东庐山。东庐山生态源区由溧水县城东南的东庐山、马占山、双尖山等构成，森林植被面积约40平方公里，具有秦淮河源头保护、水源涵养以及重要森林景观保护功能。西南片-牛首山、祖堂山。牛首山-祖堂山生态源区，规划面积40平方公里，是江宁河源头地区，森林资源丰富，是南京城乡结合部上的重要生态功能保护区。列为中华虎凤蝶的物种和生境保护地。
（3）扩展生态人居用地。最大限度地设立各类生态用地，列为限制开发地区。以生态网架为基础、生态源区为核心，将网架外分布的山丘林地、河湖湿地等生态用地链接在网架，并借助绿色廊道、水廊道及交通走廊，建设生态绿楔，嵌入重点开发园区、产业组团、主城、新市区以及“三城九镇”。在工业区、城市组团间建设各类生态防护带；南京化学工业园周边，以及长芦、玉带区间建设生态防护带，防范工业污染影响。在南京经济技术开发区、燕子矶栖霞工业集中区、龙潭经济开发区南侧建设防护隔离带，与南部的仙林大学城之间形成一个生态屏障。规划建设郊野公园、城市森林公园。建成牛首祖堂山、云台山、青龙山、汤山、栖霞山、兴隆湿地、灵岩山、八卦洲、老山、绿水湾湿地等十五大郊野公园，总面积约450平方公里；建成中山陵、幕府山、雨花台、河西滨江-江心洲、方山、石闸湖、灵山-桂山、龙池、太子山、龙王山十大城市森林公园，总面积约80平方公里。建设多而分布合理的公园和绿化行道、绿地，使人随处感受到绿色，亲近自然。
3、实施生态空间管制。
在市域范围划分三类生态功能和管制区：生态保育与禁止开发类型区、生态保护与限制开发类型区和生态维护与引导开发类型区。
（1）生态保育与禁止开发类型区。列为生态保护优先区域，是禁止开发建设空间。涵括生态网架和生态源区的森林植被、以及水源地和重要生态功能区，约占全市土地总面积的7%，是核心保护地区。包括：秦淮河源头水源涵养区、秦淮河与石臼湖分水地区、石臼湖与太湖分水地区、100米等高线以上和坡度大于25°的丘陵山地；长江集中式饮用水源保护区与重要洲滩湿地、重要湖泊与水库供水水源地等；地震活动断层带等。禁止进行任何类型的城镇与产业开发，加强生态环境保护，保持原生态状况。
（2）生态保护与限制开发类型区。列为生态保护重点区域，是限制开发区。涵括生态网架边缘及以外的部分基本农田和丘陵坡麓地带，约占全市土地总面积的14%。部分高程在10～100米间，坡度小于25°的平缓、高黄土岗地和丘陵坡麓地带。现阶段不宜规模开发建设，按基本农田保护，发展都市型生态农业及生态观光旅游业。
（3）生态维护与引导开发类型区。涵括生态网架以外的平原圩区及部分岗地，总面积约占全市土地面积的79%。在保持基本生态功能不遭受破坏的前提下，分三类进行开发建设控制与引导，合理从事各类开发活动。基本农田保护地区，属限制发展区域，发展现代农业，构建都市型生态农业体系；主城及工业集中区，属优化提升区域，进行生态修复与环境综合整治，削减污染工业开发和城镇建设强度，改善生态环境；引导开发建设区域，属重点开发区域，占全市土地总面积34%，在与生态网架保护相协调的基础上，加快推进产业的空间积聚，科学合理地构建产业及城镇发展组团。
（4）保护重要生态功能区。根据南京生态系统特征和功能，从自然生态系统和人文生态系统两方面，在市域范围内划定重要生态功能保护区共11大类、67处，总面积1129平方公里，占南京市国土面积的17.2%。其中，水源涵养区总面积154.37平方公里，占全部重要生态功能区的13.7%；饮用水水源地135.58平方公里，占12.0%；自然保护区面积8.00平方公里，占0.7%；森林公园总面积122.46平方公里，占10.5%；风景名胜区总面积408.85平方公里，占36.2%；地质及古生物遗迹89.31平方公里，占7.9%；自然与人文景观总面积3平方公里，占0.3%；生态公益林总面积90.3平方公里，占8.0%；重要渔业水域总面积30平方公里，占2.7%；重要湿地总面积82.58平方公里，占7.3%；清水通道维护区总面积6.66平方公里，占0.6%；洪水调蓄区总面积1.90平方公里，占0.2%。这些地区属于南京市域范围内生态敏感、脆弱的地区，需要优先保护，对于核心地区禁止工业及城镇开发活动。
（二）以发展循环经济为重点，构建生态产业体系
树立循环经济理念，探索发展循环经济的有效途径，大力推进产业结构调整，走新型工业化道路，积极发展生态农业、生态服务业，推动“资源-产品-废弃物”的传统增长模式向“资源-产品-废弃物-再生资源”的循环经济模式转变，降低资源消耗，减少环境污染，提高经济、社会和环境效益。
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