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总、分机构均由省地税局直属局负责企业所得税征收管理的，仍由省地税局直属局负责征收管理，并按本通知规定将总、分机构应缴税款分别向当地征解入库。
比例分配，是指总机构统一计算的当期应缴企业所得税，按照上一年度总机构和分支机构的经营收入、职工工资和资产总额三个因素在总机构和各分支机构之间进行分配（总机构所在地同时设有分支机构的，其分支机构同样按三个因素参与分摊），分摊时三个因素的权重依此为0.35、0.35和0.3。
总机构或某分支机构的分摊比例＝［（该机构经营收入÷总机构和各分支机构经营收入总额）×0.35＋（该机构职工工资÷总机构和各分支机构职工工资总额）×0.35＋（该机构资产总额÷总机构和各分支机构资产总额之和）×0.3］×100%
如果总机构按上述办法计算分摊的比例达不到25%的，按25%计算，剩余75%部分再在各分支机构之间分摊。
某分支机构的分摊比例＝［（该分支机构经营收入÷各分支机构经营收入总额）×0.35＋（该分支机构职工工资÷各分支机构职工工资总额）×0.35＋（该分支机构资产总额÷各分支机构资产总额之和）×0.3］×75%
以上公式中分支机构仅指需要参与总分机构企业所得税分配的分支机构。
当年新设立的分支机构第二年起参与分摊，当年撤消的分支机构，撤消当年剩余期限内应分摊的企业所得税并入到总机构应分摊的税款中，由总机构按规定申报缴库。
税款分摊比例按上述办法一经确定后，当年不作调整。
就地缴纳，是指总机构和各分支机构按核定的分摊比例计算的当期应纳企业所得税，就地向所在地主管税务机关申报缴库。
3、纳税申报
每年二月底前，总机构应将总机构及各分支机构上一年度的经营收入、职工工资和资产总额以及据此计算的分摊比例造列清单（即《中华人民共和国企业所得税汇总纳税分支机构分配表》），送总机构和各分支机构所在地主管税务机关，总机构和各分支机构所在地主管税务机关审核盖章后，返回总机构，由总机构报主管税务机关核定。每年三月底前，总机构将核定的当年度分摊比例正式下发给各分支机构和分支机构所在地主管税务机关，作为纳税申报的审核依据。
总、分机构企业所得税实行按月或按季申报，就地预缴。总机构应与每月或每季度终了之日起十日内，将统一计算的企业当期应纳企业所得税额，按上述核定的分配比例，计算总机构和各分支机构当期应纳税额，统一造表（即《中华人民共和国企业所得税汇总纳税分支机构分配表》）分送分支机构，由总机构和分支机构分别向所在地主管税务机关办理纳税申报，预缴税款按照皖财预〔2008〕637号文件规定的预算科目和级次缴库。
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