（二）运行方式。严格按照《自治区人民政府关于新型农村合作医疗工作的指导意见》等文件做好资金筹集、支出、运行等工作，确保资金安全。
1、资金收缴。县（市、区）政府组织收缴农民的合作医疗资金。农垦系统的农村居民由所在农场负责收缴。收取资金要详细登记《新型农村合作医疗资金收缴登记表》，并出具“宁夏回族自治区财政厅统一收据”，同时在《新型农村合作医疗证》“统筹资金交费记录”一栏中登记签名盖章方可生效。在收缴农民个人费用时，原则上当天收费当天上交，特殊情况三天内收缴的经费必须上缴到县（市、区）新型农村合作医疗基金专户。
2、资金支出。新型农村合作医疗管理中心在基金代理银行设立支出帐户，由财政局每月预拨一定的经费到支出户。农民在县（市、区）以外或非定点医疗机构住院，可由合作医疗管理中心从支出帐户提取现金办理补偿。农民在县（市、区）、乡（镇）、村定点医疗机构就诊，先由定点医疗机构初审并垫付报销费用，定点医疗机构按月向县（市、区）新型农村合作医疗管理中心申报，经审核后报财政局审批，财政局审核后向财政专户下达拨款通知，与相关定点医疗机构办理结付。
五、基金分配
根据新型农村合作医疗统筹模式，合理分配合作医疗基金。在住院统筹加门诊家庭帐户模式的基础上，逐步探索建立住院统筹加门诊统筹模式，总结经验，完善政策，逐步施行。
（一）住院统筹加门诊家庭帐户统筹模式：合作医疗基金分配为家庭帐户基金和住院补偿基金两部分。
1、家庭帐户基金：按参合者每人每年11元的标准，以户为单位设立家庭帐户，主要支付门诊医疗费用，节余资金可以结转到下一年度使用。
2、住院统筹基金：按参合者每人每年89元的标准，设立住院统筹基金，主要对住院费用进行补偿。
（二）住院统筹加门诊统筹加家庭帐户模式（过渡模式）：除家庭帐户基金外，另从住院统筹基金中提取一定的资金设立门诊统筹基金（参考标准为川区每人19元，山区25元）。此项基金主要用于慢性病或其它疾病门诊费用的补偿，为向住院统筹加门诊统筹模式的转变打下基础。
（三）住院统筹加门诊统筹模式：合作医疗基金分门诊统筹基金和住院统筹基金两部分，分别对参加合作医疗者住院费用和门诊费用进行补偿。
六、补偿办法
