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（一）水利工程实行统一和分级管理相结合的管理体制
1.市直管的水利工程由市水行政主管部门管理。
2.中型水利工程由县水行政主管部门管理。
3.小型水库由业主单位和所在乡（镇）人民政府管理。
4.集镇饮水工程，由当地乡（镇）人民政府管理。
5.农村五小工程，根据谁建谁所有、谁受益、谁管理的原则，明确管理人。
（二）水行政主管部门和水管单位的管理责任
市、县人民政府的水行政主管部门负有行业主管责任，负责监督检查水利工程的管理养护和安全运行。工程所在地的乡（镇）人民政府负责保障本区域内水利工程的安全。
水管单位具体负责水利工程的管理、运行和维护，保证工程安全和效益的发挥。
（三）全面推行水管单位改革
根据水管单位的性质和特点，在科学划分公益性资产和经营性资产的基础上，对内部承担防洪、排涝等公益性职能部门和承担供水及多种经营的职能部门进行严格划分，将经营性部门转制为水管单位下属企业，独立核算。分类推进人事、劳动、工资等内部制度改革。建立岗位管理制度，按照“因事设岗，精简高效，合理导向”的原则，科学设置不同类型、不同层次的岗位数额，明确各岗位的职责、权利、工作目标、任职条件和聘用（任）期限，实行岗位管理。事业性质的水管单位要严格控制人员编制，全面推行聘用制和竞争上岗。
（四）积极推行管养分离
把水利工程维修养护业务剥离出来，逐步推向市场。同级财政部门要核定事业单位性质的工程维护资金。
（五）妥善分流人员，落实税收和社会保障政策
1.支持和鼓励分流人员大力开展诸如发电、旅游、水产养殖、水利工程维修等具有行业和自身优势的项目。利用水利工程和保护区域内的水土资源兴办企业的，要优先使用水管单位分离人员。
2.落实社会保障和税收优惠政策。各类水管单位要积极参加基本医疗、失业、养老等社会保险。改革前水管单位欠缴的社会养老保险由同级财政解决。为安置水管单位分流人员而兴办的实体，执行相关的税收优惠政策。
（六）完善新建水利工程管理体制
建设过程中要克服重建轻管，甚至不管的现象，推行建设项目法人责任制、招投标制、工程监理和质量终身制。新建项目的建设与管理要同步推进，同时具有建设和管理方案。对缺少管理方案的不予立项、审批。
（七）改革农村小型水利工程管理体制
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