三、所长任期目标、“三保一挂”年度考核与对所长奖罚。
实行“三保一挂”承包经营责任制的前提条件是实行所长任期目标责任制。所长任期目标是承包经营责任制的重要考核内容。
承包经营责任制试行一定4年，按年考核，逐年增长，局部调整的办法。年度指标与所长任期目标应协调一致。每年年终，所长应将所长任期目标、年度考核“三保”指标和下列考核项目完成情况，连同纯收入分配申报表（见附件（3））书面报局（总公司）抄报市科委等部门，并由局（总公司）验收合格后，核准应增减工资总额或奖励基金提奖率。
（1）追踪本年度全部或若干重要项目的技术成果转让投产和智力、技术投入后的销售额、利税、增收节支、增汇节汇等社会经济效益数（每项成果投产或应用后，一般可追踪计算5年）；
（2）完成鉴定的成果数、推广应用数，特别是在本市投产应用推广的科研成果数，及已经达到或计划达到的宏观效益。
（3）与生产企业（重点是本市企业）建立联合组织，特别是联合体和进入企业集团的进展情况；
（4）核减事业费计划及完成情况；
（5）人员培训计划和人员结构合理化计划完成情况。
以上考核项目完成情况的好坏，是确定工资总额或奖励基金挂钩增减幅度上限或下限的主要依据。凡改革成效显著，通过成果、技术和智力的横向转移，形成社会生产能力，取得显著经济效益和社会效益，超额完成科技承包经营目标和所长任期目标的科研单位，经上级主管部门审核后，正、副所长的个人收入可以高于本单位职工个人平均收入的一至三倍，或获得一次性奖励。未完成目标的，酌情减扣正、副所长的个人收入。
四、关于奖金税
实行工资总额同“三保”指标完成情况挂钩的单位，实行工资调节税，按财政部（87）财税字第010号文件中规定的工资调节税办理。其有关指标由市税务局参加审定。
实行奖励基金同“三保”指标完成情况挂钩的单位，实行科研单位奖金税，按财政部、国家科委（87）财税字第012号《关于对科研单位征收奖金税问题的通知》办理。
五、实行科技承包经营责任制单位所长的权力：
在实行所长负责制已有自主权基础上，扩大以下科研所的自主权。
（1）有权聘用各类科技人员，拒收不适合本单位工作的人员。对违纪职工可以辞退，对不适合科研工作的多余人员可试行编外办法，对编外人员和不服从调动的人员，可以酌情减发工资。有权批准职工辞职、停薪留职、带薪留职、外出兼职和派出人员。
