第十五条 水管单位应当建立健全水费交缴的现金及有关票据内部控制制度，加强对水费收缴的管理，保证水费及时、足额收取。
第十六条 水管单位当月取得的水费收入应当于次月的15日之前足额存入本单位银行基本帐户，不得隐匿或帐外设帐、私设“小金库”和公款私存。
第十七条 水管单位生产经营用固定资产和公益服务用固定资产均应提取折旧。水管单位在保证水利工程正常生产运行的同时，应认真按财务制度规定的比例作好水利工程固定资产折旧费的提留和积累。
第十八条 水管单位应按照《水利工程供水生产成本、费用核算管理暂行规定》，加强成本、费用管理，正确归集，定期核算，有效地控制供水生产成本、费用。水管单位要严格控职人员编制，控制人员工资成本，按岗位、流域核定人员。
第十九条 水管单位供水生产经营发生的年度亏损，可以用下一年度的水费结余等弥补，下一年度不足弥补的，可以在5年内延续弥补，当年水费收入的结余资金，可以连年结转使用，做到“以丰补欠”。5年内弥补不足的，并且亏损原因是由于水价不到位等政策性问题所造成人员工资超支、养老保险以及住房公积金欠缴等问题，水管单位报请各县市政府和同级财政解决，不得用固定资产折旧弥补其他供水生产成本和期间费用等开支，各县市水管单位必须确保水利固定资产保值。由于水价不到位造成固定资产折旧未提计的，报请当地财政局、国资委同时上报地区财政局、国资局、地区水利局采用历年国家投入用于水管单位水利工程维修更新的专项资金所形成新的固定资产核增核减。
第二十条 水管单位应于年初根据水源情况、用水计划和工程维修改造计划等，编制年度水费收支计划，报经县市水利主管部门和财政部门审查，报县市主管领导审核后，上报地区水利局，财政局批准，年终向各县市主管领导及财政局、水利局以及地区财政局、水利局提交该年度水费实际收支情况报告。
第二十一条 水管单位必须按照近年来为加强水利工程基础设施建设贷款“日协”及“世行”资金修建水利工程的要求建立还贷专项资金，建立还贷专户。还贷资金从每年水费固定资产折旧中提取；吐鲁番市水管总站每年提取还贷准备金60万元；鄯善县水管总站每年提取还贷准备金80万元；托克逊县水管总站每年提取还贷准备金50万元。
