新型农村合作医疗费用每人每年累计补偿限额为40000元。参合农民如果在年度内住院两次以上的，只设置一次起报点。
第二十二条 参合农民中患恶性肿瘤、尿毒症、肾病综合症、肝病、肺气肿的患者，没有住院而发生的大额治疗费用，由县（区）合管办依据患者病历记录和实际发生费用情况，按照50%的标准每季度集中补偿一次，但每人每年补偿总额不得超过10000元。如患者死亡可及时补偿。
第二十三条 孕产妇住院分娩纳入新型农村合作医疗住院补偿范围，按照本《办法》第二十条规定分段分档按比例补偿。其中，对于参加妇幼保健保偿的孕产妇住院分娩达3天以上，补偿所得不足200元的，按定额200元补偿。新生儿疾病筛查每例补偿20元。
第二十四条 参合农民在就医过程中作下列特殊项目的检查和治疗，所发生费用按10%比例补偿：
（一）应用CT、核磁共振、正电子发射断层和扫描装置（PET）、眼科准分子激光治疗仪、光量子治疗仪等医疗设备进行的检查治疗项目；
（二）立体、定向放射装置（γ-刀，X-刀）；
（三）超声乳化治疗白内障、前列腺气化仪治疗前列腺肥大、微电极介入治疗、心脏激光打孔、抗肿瘤免疫治疗和快中子治疗项目。
第二十五条 对全年未享受合作医疗补偿的参合农户，每户限定1人进行一次常规性体检。
第六章 非补偿范围
第二十六条 未按转诊程序自行择医、自购药品、输血（白血病除外）及超出《宿迁市新型农村合作医疗基本药物目录（试行）》的医疗费用，全部由个人自理。
第二十七条 在就医过程中发生的下列费用，不属于新型农村合作医疗基金补偿范围：
（一）在各级医疗机构发生的非基本医疗（主要指高等病房、特种病房、特需护理、家庭病床等）和康复性医疗的费用。
（二）未经物价和卫生部门批准的医疗机构医疗服务、检查、治疗项目，以及擅自抬高收费标准所发生的一切费用。
（三）打架斗殴、酗酒、吸毒、性病、交通事故、故意自伤自残、非生产性农药中毒、医疗事故（纠纷）、工伤及计划生育所需的一切费用。
（四）挂号费、病历工本费、出诊费、点名手术附加费、中药煎药费、就医差旅费、救护车费、陪客床费、包床费、会诊费、伙食（营养）费、生活用品费、证书费、保健档案袋费、担架费、空调（含取暖）费、电视费、电话费、个人生活料理费、护工费等。
