1.符合条件的福利企业实际支付给残疾职工的工资据实在税前扣除。
2.实行核定征收企业所得税的福利企业不享受财税[2006]111号文和国税发[2006]112号文规定的福利企业所得税税收优惠政策。
3.享受福利企业所得税优惠政策的福利企业，在2006年度企业所得税纳税申报时，按照以下规定进行处理：
（l）2006年1-9月实际发给残疾职工的工资不得据实扣除，按原有税前扣除工资政策执行，10-12月实际发给残疾职工的工资按现行规定据实扣除。
（2）年度纳税申报前，税务机关已批准2006年度享受减税或免税的福利企业，其2006年度计算出的税款，按75%的比例减征或免征。
（3）按照财税[2006]135号文第六条规定，盈利的福利企业2006年10-12月按实际支付给残疾职工工资额计算的允许加计扣除的部分乘以33%，计算出福利企业2006年度10-12月享受福利企业所得税优惠政策免征的税款。
（4）将上述第（2）点和第（3）点计算出的免税税款相加，得出福利企业2006年减征或免征的企业所得税，并填入《企业所得税年度申报表》附表七《免税所得及减免税明细表》第43行中。
三、残疾人安置比例计算问题
根据国家对有劳动力能力的残疾人员应就地安置的原则，纳税人安置持有本省跨地区（含深圳市）有关部门核发的残疾人证件的残疾人，可参与残疾人比例和可退税限额的计算。安置持外省（市）有关部门核发的残疾人证件的残疾人和不符合《中华人民共和国劳动法》及有关规定的劳动年龄的残疾人，暂不列入安置比例和有关退税或减税限额的计算。
四、福利企业享受税收优惠资格的认定程序
（一）安置残疾人就业的企业需要申请享受增值税或营业税、企业所得税优惠政策的，应当分别向主管国税机关、地税机关提出认定申请。
（二）申请享受税收优惠政策的福利企业向主管税务机关提出申请时，应提交以下资料：
1.减免税申请报告，《福利企业税收优惠资格认定申请审批表》（附表1）；
2.《广东省社会福利企业证书》，民政部门对企业安置残疾人员比例、企业是否具备福利企业资格等书面审核认定意见；
3.在职职工名册和《福利企业残疾人员用工情况登记表》（附表2）；
4.企业与残疾人员签订的劳动合同及每位残疾职工的残疾人证；
5.企业为残疾人员缴纳基本养老保险、基本医疗保险、失业保险和工伤保险等社会保险的有关证明材料；
6.企业通过金融机构向安置每位残疾人员支付不低于所在县（市）最低工资标准的工资的凭证。
