取水申请批准后，申请人方能动工兴建取水工程。取水工程完工，须经竣工验收合格，方能按程序取得正式的取水许可证。
对妨碍公共用水、环境安全或者损害他人用水合法权益的，水行政主管部门有权限制取用水或者禁止取用水。
下列五种情形不需要申请取水许可：
（一）农村集体经济组织、公共社会事业取用水的；
（二）家庭生活和散养、圈养畜禽少量取用水的；
（三）为保障矿井等地下工程施工安全和生产安全必须进行临时应急取（排）水的；
（四）为消除对公共安全或者公共利益的危害应急取用水的；
（五）为农业抗旱和维护生态与环境应急取用水的。
第十一条 在自治州辖区内直接从江河、湖泊、地下调度和取用水资源并需要申请取水许可的新建、扩建、改建的项目，建设单位或者个人应当在办理取水许可申请前，向水行政主管部门提交建设项目水资源论证报告书。未提交的，水行政主管部门不得受理取水许可申请。
州、县水行政主管部门按照分级管理权限，遵循“谁发证、谁组织、谁审查”的原则，负责建设项目水资源论证的组织、审查和报批工作。
工程建设单位或者个人在向建设项目的审批部门报送建设项目可行性研究报告时，应当提交水行政主管部门的取水许可批准文件，并附建设项目水资源论证报告书。未提交的，建设项目不予批准、核准、备案。
第十二条 取、用水涉及第三方利益的，水行政主管部门应当在收到取水许可申请之日起七个工作日内向社会公告。第三方对取水许可申请有异议的，应当在公告后十个工作日内向公告机关提出。
第十三条 州、县人民政府在管理权限内应当按照市场化配置资源的方式公开出让水能资源开发权。获得水资源开发权的公民、法人或者其他组织应当向水行政主管部门缴纳水资源补偿费。
依法获得开发权、取水权的公民、法人或者其他组织，经原发证机关批准，可以依法有偿转让、出租或拍卖，并按有偿使用原则变更相关手续。
跨县域进行水资源使用权转让，应当符合水资源保护规划，并经过专项论证，由州水行政主管部门办理。
第十四条 自治州对辖区内调度、取用地表水、地下水，依法征收的水资源费和对水电站装机二十五万千瓦及其以下征收的水资源费除上缴中央部分外，其余全部专项用于自治州水资源的涵养保护、节约、规划管理和开发利用，并由同级财政监督使用。
