--加强以“良种、良养、良料”中心的养殖业科学研究与技术开发，使良种覆盖率达到90%以上。加快畜、禽、水产和饲草的新品种引进、培育、推广，饲草、饲料的加工、调制技术的开发和应用。推广奶牛、肉牛、毛肉兼用羊、细毛羊的优良品种快速繁育技术和科学饲养技术。加强畜禽疫病的研究与防治技术开发，完善畜禽疫病防治技术体系。
--加强山区林和荒漠林恢复保护的研究，加大对“三北”防护林和防风治沙工程的技术支持。加强提高速生丰产林质量的技术开发。为特色林果基地建设选择和提供良种、壮苗和丰产栽培技术。完善病、虫、鼠害的预报和防治技术体系。
二、重大选项
1、特色动植物新品种选育
应用品种引进、系统选育、杂交改良、杂种优势利用、辐射育种、细胞融合、基因转导和分子标记等技术，培育粮食作物、经济作物、园艺作物等优质、专用、抗逆新品种60-80个，并获得新品种保护权10-20个以上。
--选育优质、高产、抗1-2种病虫害的陆地棉、长绒棉、适合机采的棉花新品种8-10个和高产、抗病、含糖量16-18%的常规种、杂交种、遗传单粒甜菜新品种 3-5个。
--选育优质、抗病虫、抗寒、耐盐碱、高产的水稻、小麦（包括专用小麦）新品种5-10个。
--选育优质、抗病、耐储运的葡萄、甜瓜、西瓜5-10个；选育优质、抗病、耐储藏、适合加工、设施栽培和矮化栽培的香犁、核桃、杏、无花果新品种8-10个。
--培育高产纤维材、建设用材、速生丰产、园林绿化及抗旱、耐盐碱、抗风沙的乔木、灌木新品种和蛋白质含量在20%以上的高产优质饲草，用于绿化的草坪草新品种8-12个。
--选育超细型细毛羊新品种、绒山羊新品种及肉牛、肉羊、禽类新品种。通过引进或本土鱼驯养，筛选出适合新疆生态条件的鱼类品种3-5个。
2、干旱区现代高效农业节水技术开发和节水设备研制
开发农艺节水、地面灌溉节水新技术，喷、微灌、滴灌高新节水与信息化管理新技术、新装备， 水资源合理开发利用和合理调配新技术，建立现代高效节水农业技术保障体系。筛选出抗旱节水农作物新品种8-10个，研制高效抗旱剂1-2个。在南北疆设试验示范区4个，每个示范区面积5万亩，使水的利用系数达到0.6以上，单方水粮食生产能力达到1.5公斤/m3以上 。
3、新疆动植物重大疫病（病虫害）综合防治技术开发
--动物（畜禽）重大疫病预防与控制技术开发
