在科技研发方面，深圳由于缺乏本土高等院校支撑，研发技术力量薄弱，相比于北京、上海、浙江、江苏、广州等地存在较大差距。
6、对行业从业人员的管理和培训需要加强
作为药品生产、经营和指导合理用药的实践者和主导者，药学技术人员的作用没有得到很好地发挥。为应付激增的市场需求，对从业人员的管理仅停留在核发上岗资格层面。十一五期间，如何解决市场主体“人”的管理问题，是一个艰巨而复杂的课题。
7、保健食品化妆品监管工作相对薄弱
保健食品化妆品监管工作2004年接手，起步晚、头绪多、任务重，监管力量相对薄弱。
保健品监管方面，由于企业规模小、水平低，生产经营质量管理体系建设相对落后，行业从业人员素质较低，假冒伪劣产品和非法添加现象较为严重，消费者对保健食品认识不清、维权意识不强等问题，导致监管困难重重。
化妆品监管问题则尤为突出，一方面存在监管体制尚需进一步理顺以及法律法规不健全、检测标准缺失等问题。另一方面由于化妆品经营市场不设门槛，企业点多面广，进货渠道众多，质量良莠不齐，假冒伪劣和走私水货充斥市场，导致化妆品监管举步维艰。
（三）机遇与挑战
1、党和国家当前的宏观政策为食品药品安全事业的发展提供了良好机遇
党的十六届三中全会提出了以人为本的科学发展观，十六届四中全会提出了构建社会主义和谐社会，十六届五中全会和中共中央经济工作会议又提出解决关系人民群众切身利益和生命安危的食品药品安全问题。党和国家主要领导人亲自过问食品药品安全问题，各省市各级政府纷纷加大食品药品安全工作力度，这既给食品药品安全工作提出了更高的要求，也为食品药品安全事业发展提供了良好机遇。在深圳，市第四次党代会提出建设“和谐深圳效益深圳”目标时，也将加强食品药品安全工作纳为重要内容。市政府对于人大《关于加强食品安全监管工作的议案》办理工作更是给予了高度重视，深圳的食品药品安全事业当前正处于一个非常好的历史发展机遇期。
2、食品药品安全形势对食品药品安全事业提出了新的挑战
近年来，食品药品安全已成为全球性公共安全问题，世界范围内屡屡发生疯牛病、苏丹红等重大食品安全事件，涉及范围广、危及人体健康和生命安全，使食品安全问题受到了世界各国前所未有的关注。许多国家将食品药品安全纳入了国家公共安全的范畴，在完善相关立法的同时，采取了更多监管措施。国际上，近几年来欧盟已先后出台了涵盖所有食品的几十项新法律法规，为食品安全制定了十分具体的标准和监管程序。美国从重点预防食源性疾病入手，强化了食品安全的立法与监管。在国内，阜阳劣质婴幼儿奶粉等严重危害人民群众身体健康和生命安危的食品安全重大事故，引起了党和政府的高度重视，2003年开始，吴仪副总理亲自部署，八部委联合行动，在全国范围内实施食品药品放心工程。鉴于此，加强食品药品安全监管工作形势逼人。
3、食品医药产业的发展要求进一步改善食品药品市场环境和经济秩序
食品药品安全保障水平的高低，最终决定于食品医药产业生产力的发展水平，而产业发展水平在很大程度上又依赖于市场环境的优劣。因此，食品药品安全监管工作和产业发展是互为促进、相辅相成的关系。当前，我国食品产业发展处在一个从传统手工作坊式生产模式向工业化集约化模式转化的过程，而医药产业则面临着提升自主创新能力，扩大自身规模应对国际化市场冲击的形势，如何净化食品药品市场秩序、优化市场资源配置、营造适合食品医药产业发展的市场环境，将是食品药品安全监管事业的又一重要任务。
二、总体思路与目标
（一）指导思想
以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真贯彻党的十六大和十六届三中、四中全会精神，按照深圳市第四次党代会和市委四届一次会议的总体部署，全面落实以人为本的科学发展观，紧紧围绕建设“和谐深圳、效益深圳”和国际化城市的目标要求，牢固树立“立党为公、执政为民”的信念，求真务实，开拓创新，努力构建完善一个融行政执法、行业自律、舆论监督和社会参与为一体的食品药品监管新体系，坚持依法行政，坚持“健全体制、明确责任，居安思危、预防为主，强化法治、依靠科技，协同应对、快速反应，加强基层、全面参与”的监管方针，深入整顿规范我市食品药品市场秩序，促进我市医药经济快速、协调、持续发展，切实保障人民群众的饮食和用药安全。
（二）预期目标
“十一五”期间，我市食品药品安全事业发展总体目标为：到2010年，构建起以法律法规为依据，监督网络为基础，信用体系为载体，信息技术为支撑，行政监督与技术监督紧密结合，行政执法与行业自律、舆论监督、群众参与相结合的食品药品监管体系，使深圳成为监管基础实，行政效率高，市场秩序和发展环境优，食品药品安全防御和保障机制比较完善的城市。
围绕上述目标，“十一五”期间要实现“五个显著提高”的具体目标：
