3．软件工业化生产
开发可重复利用和组合的软件单元或软件模块，以工业化、工厂化和自动化方式设计和生产普及型软件。
4．集成电路设计
采用设计、制造一体化、代工和无生产线芯片设计模式并行方式，引进用于无线网络的芯片组设计技术，开发通讯MCU芯片和化合物半导体材料的芯片。
5．功率型、高亮度、低成本固态照明光源
组织发光二极管上、中、下游产业链联合研发，白光发光管和其它固态光源达到国内领先水平，实现国家半导体照明工程战略目标。
6．多功能数字化智能显微系统
开发新一代数码显微系统，实现实时信息获取，识别与处理，可远程网络化遥控，形成多种学科技术集成创新的实时互动数字化智能显微科学仪器、设备、装置和系统。
7．功能纳米材料制备及应用
研究纳米材料可控制备与生长技术，开发高性能稀土纳米功能材料、纳米生物材料、纳米发光材料，制备有独特功能和结构的改性功能材料。
8．高强度钨特种合金系列产品
发展钨材料硬质合金，特种合金深加工制造技术，表面纳米化技术，开发钨特种合金粉末加工，突破亚微细、微纳细钨合金及高精度挤压制品制造技术。形成多功能高强度钨特种合金系列产品。
9．海水淡化与综合利用
厦门水资源匮乏，海水淡化是解决水资源问题的根本途径。进一步研究完善海水淡化产业化技术，降低成本，开发大生活用海水处理技术和海水淡化生产技术设备。
10．基因重组药物和蛋白质药物
研究基因克隆、基因重组工程技术，开发基因药物、基因重组蛋白质药物等。
11．微生物、工业生物和酶
厦门微生物种类丰富，从中筛选出具有开发前景的酶和生物活性物质，应用微生物技术生产化学物质和能源等工业产品；开发微生物细胞及其酶蛋白工业生物催化剂。
12．传染病、肿瘤诊断试剂与疫苗
研究开发艾滋病、白血病、肝炎、禽流感、结核杆菌等传染病诊断试剂盒和疫苗，肿瘤早期诊断试剂与诊断方法工程技术产品。
13．手性药物
研究手性化合物及其两个对映异构体的不同生物活性；手性药物中所含的对映体各自的药理作用、毒性和临床；手性药物新分离制备技术；开发药效高、副作用小，用量少的手性药物，特别是通过综合应用拆分、手性辅助剂及不对称催化等方法，制备出组分更纯的具有单一定向结构的手性药物。
14．生物中药
根据《中药现代化纲要》，采用现代工业生物技术，研发植物药有效成分的生产、加工、提取的工业化方法，解决中药的农药残留、重金属超标、有效成分失效等问题，制造安全、可靠、疗效好的现代中药。
15. 实时交通信息网络和智能化综合交通控制管理系统
实时交通信息网络是集信息技术、通信技术和软件技术的系统工程。交通控制管理系统主要包括交通管理系统、出行信息服务系统、商用车辆运营系统、电子收费系统、公共交通运营系统、应急管理系统及智能化车辆控制系统等，还包括交通数据采集设备、大容量存储数据库、显示终端及发布实时交通信息终端设备。
16. 台湾海峡及周边海域海洋立体实时监测系统
开发遥感和雷达监测技术、水面与水下自动监测技术、移动目标探测技术、组网技术及系统集成技术，构建实用的台湾海峡及周边海域立体实时监测系统，基本形成对离海岸400公里海洋动力环境信息的获取和应用技术能力。
五、区域科技创新体系建设
未来10～15年厦门市应加强技术创新体系、知识创新体系、科技中介服务与成果转化体系、科技宏观管理体系等四大创新体系建设，形成良性互动、有机统一、以产业技术体系为主的区域科技创新体系。
（一）技术创新体系
强化以企业为主体、市场为导向、产学研紧密结合的技术创新体系，支持技术创新能力强的大中型企业建立高水平研发机构和国家级研发中心，围绕新产品研制和开发，针对生产中的关键技术难题、装备改造以及引进技术及设备的消化吸收进行攻关和创新。重视和发挥科技型中小企业在自主创新、发展高新技术产业中的生力军作用。鼓励多部门联合科技攻关，提高原始创新和集成创新能力。推进企业博士后工作站、工程技术研究中心和企业技术中心的建设，加强行业共性技术研发平台的建设。
（二）知识创新体系
