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1．海洋资源开发
海水利用。开发海水循环（直流）冷却技术，解决大生活用海水后处理工艺的关键技术问题；开展降低能耗和成本的海水淡化技术研究，开发海水淡化关键材料，可规模化应用的海水淡化装备和多联体耦合关键设备；加强浓盐水综合利用、海水化学资源综合利用技术研究。
海洋活性物质与药物的提取与应用。研究海洋生物活性物质筛选技术，突破海洋生物和生物资源利用领域的关键技术，建立作为新药资源和药物筛选工作基础的大规模样品库；研发海洋抗癌药物、心脑血管药物、抗菌药物、抗病毒药物、消化系统药物、免疫调节作用药物、骨关节炎特异性药物等；开发海洋功能食品和海洋保健品；建设海洋生物技术中试转化平台、规模化海洋药物生产基地。
开展极端微生物应用研究，开发工业用极端酶、工具酶及其在生物冶金等领域的应用。
2．海洋资源可持续发展
海洋物种资源调查与保护。开展海洋与海岸生物遗传图谱构建和标记辅助选育的研究，重要海洋珍稀物种保护及人工繁育等关键技术开发，建成海洋生物遗传育种平台。
海洋生态研究。开展环境污染形成机理与生物修复、控制理论研究，减少海洋重金属污染的研究，陆海相互作用与海岸带生态修复研究，滨海湿地的形成、演化、退化与修复技术及试验，进行厦门海域生态修复工程实践。
海洋环境保护。开展海岸与海洋生态系统动力学、演化、服务功能及调控研究，进行重要港湾动力沉积关键过程与淤积灾害防治，重大工程建设对近岸和港湾动力与生态环境的影响及对策研究。开发海洋生态与环境检测技术与设备。
（五）现代服务业
围绕城市定位，以科技推进临港大工业和建设先进制造业基地为先导，坚持应用需求导向，依托信息技术和现代管理方法，开发支撑和带动现代服务业发展的高新技术和关键产品，实现现代服务业的跨越式发展。
1．港口物流
发展无损识别技术、大型数据库技术、全球定位系统空间管理技术、电子订货系统、电子数据交换、快速反应及有效的客户反馈、资源管理系统等；发展物流安全管理技术系统、交互式高可靠物流信息系统、商品信息编码体系等方面标准化技术；形成以港口为中心、服务于电子口岸大通关的共用物流信息平台。
2．现代旅游
发展实时网络预定、增强用户界面友好性和实用性的旅游目的地营销管理系统配套技术，建设旅游业的共性技术平台。开发自然科考旅游、生态旅游、海洋旅游、产业旅游、科技馆博物馆旅游和科技夏令营等科技旅游产品形式。
3．金融服务
发展基于互联网的电子银行安全风险评估和监控技术；完善信贷风险管理、客户关系管理、资产负债管理、金融监管和信用信息基础数据库等为代表的决策支持平台；促进金融产品应用系统的联通技术。
（六）农业
围绕建设社会主义新农村的宏伟目标，按照优化第一产业的战略部署，以科技进步持续提高农业综合生产能力，全面实施科技惠农富农计划，集中力量解决餐桌污染的源头问题，发挥农业对保障城市供给、生态屏障、旅游观光等作用，促进农村经济社会的全面发展。
1．农产品精深加工与现代储运
发展农产品精深加工、产后减损和绿色供应链产业化关键技术，开发农产品清洁生态型加工技术与设备及安全监测技术；开发农产品无毒害保鲜、物流配送、冷链运输系统技术，特别是鲜活水产品、特色水果的保鲜加工，培育一批有特色的名牌产品。发展远洋渔业和海上贮藏加工技术与设备。
2．生态、观光农业
开发无公害绿色食品技术，形成“基地-农户-龙头企业-品牌-市场”无公害绿色食品产业发展格局。研究开发主要农作物与水产品优良品种的育种技术，开展亚热带特色水果和花卉的生物育种、引繁、栽培等技术研究，建设具有新品种新技术引进示范、科技交流、科普教育、展示传播等功能的观光休闲农业生态科技园。研究开发综合、高效、持久、安全的有害生物综合防治技术，建立有害生物检测预警及防范外来有害生物入侵体系；发展以提高土壤肥力，减少土壤污染等为主的生态农业技术。
（七）社会科技
1．人口与健康
以开发信息资源为核心，以建设应用系统为主导，全面加快人口和健康信息化建设进程，强化基础医学和应用领域研究，做好重大疾病防治技术的研发，为提高人口质量和全民健康水平做出积极的贡献。
（1）预防医学与公共卫生
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