当前，我市经济体制改革的任务还相当艰巨。主要是：国有经济存在结构性矛盾，现代企业制度建设还有待进一步加强；政府职能转变尚未到位，管理经济的方式还需改进；“三农”问题仍较突出，妨碍农村生产力发展的旧体制还没有完全打破；卫生、教育体制的改革还不能适应社会经济发展和人民群众的迫切需要；要素市场发育不快，资本、人才等各类要素流动的市场机制还不够健全；社会保障体系建设还有待加强；经济活动的信用水平还较低等。这些影响经济社会健康发展的体制机制性矛盾和问题，只有通过深化改革，才能从根本上解决。
二、“十一五”改革的指导思想和总体目标
“十一五”期间，我国经济和社会发展将进入一个新的阶段。从全国看，面临着从总体达到小康向全面建设小康社会转变；改革面临建设社会主义市场经济体制由初步建立到完善的时期；经济全球化和加入世贸组织进入后过渡期，面临如何提高对外开放水平和掌握对外开放主动权的新挑战。从扬州看，面临着实现“两个率先”目标，全面建成小康社会的关键时期。但对照科学发展观和加快发展的要求，面临着经济在总体上还没有完全转变粗放型的增长方式；农业基础脆弱、工业自主创新能力不强、新型现代服务业相对滞后的问题还较突出；土地、能源紧缺和原材料价格上涨的压力依然较大等矛盾和问题。这些矛盾和问题明显地同体制机制创新滞后相联系，并成为今后经济社会发展的一个体制性障碍。因此，“十一五”期间，我市经济体制改革仍处于攻坚阶段。必须以更大的决心加快推进改革，创新体制机制，使关系经济社会全局的重大改革取得突破性进展。
随着改革进程的进一步加快，对深化改革提出了新内容、新要求和新挑战。
一是改革的内容发生了变化。除继续抓好国有企业改革、农村改革外，行政管理体制、社会事业单位、投融资体制等方面的改革将成为改革的重点。
二是改革的要求更高。改革更加强调坚持以人为本、规范运作。既要巩固改革成果，又要合理调整社会各方面利益；既要妥善解决历史遗留问题，又要防止出现大的波动。
三是改革的难度加大。目前的改革都是深层次改革，涉及社会方方面面的利益调整，各种矛盾将更加尖锐，社会稳定的压力较大。
“十一五”期间，全市经济体制改革的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，以建立比较完善的社会主义市场经济体制为目标，按照科学发展观的要求，坚持用发展和改革的办法解决前进中的问题，着眼于制度创新，加快推进以行政管理体制改革和事业单位改革、国有企业改革和农村改革，现代市场体系和社会保障体系建设为重点的各项改革，积极解决制约生产力发展的体制性障碍，充分发挥市场在资源配置中的基础性作用，为促进全市经济社会发展，实现“两个率先”、全面建成小康社会提供更为有利的制度环境。
根据实现“两个率先”、全面建成小康社会关键时期的目标定位，我市“十一五”期间经济体制改革的总体目标是：通过全面推进制度创新，建立现代产权制度，促进多种所有制经济共同发展；建立统筹城乡发展机制，促进城乡一体化；健全就业、收入分配和社会保障制度，促进社会和谐稳定；大力培育各类要素市场，促进资源在更大范围内优化配置；加快推进政府职能转变，促进公共服务型政府建设，积极培育体制机制新优势，为推动全市经济社会持续快速发展注入新的动力和活力。
