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（一）大力发展高新技术产业，推进产业结构的战略性调整。
高新技术产业是国民经济发展的先导产业，也是带动经济增长最具生命力的产业。从我市的实际出发，“十一五”期间我市应以信息技术、生物技术、新材料技术为重点，加快高新技术产业的培育和发展，在电子信息、新材料、生物与医药等领域，取得具有竞争力的科技成果，并实现规模化生产。不断提高高新技术产业在工业增加值中的比重。加强高新技术产业开发园区对高新技术企业的孵化功能。
1.电子信息。
加强技术引进和研发能力培育，重点研究开发新型电子元器件、电子专用设备；研究开发网络和软件技术，围绕经济和社会的信息化，引进与开发企业信息化、电子政务的共性技术，推进信息技术应用系统的技术升级；研究开发高效的公用信息交换平台；研究开发企业生产、管理和产品流通的信息网络系统，促进企业运营的信息化。
2.新材料。
大力发展纳米、新型墙体材料等新材料技术，重点研究开发多功能材料、可循环利用材料、环保型材料、玻璃钢材料、先进复合材料、高附加值磁性材料等。
3.生物与医药。
加大对生物药物和海洋药物的培育力度，重点研究天然药物有效成份提取技术、海洋动植物资源活性物质提取加工技术、新药筛选技术和新型中药制剂技术。开发一批新型海洋药物、新型化学原料药及制剂、新型中药制剂；新型高档鱼油、鱼粉、鱼蛋白、甲壳素及其衍生物；海洋保健品、多功能海洋食品；新型水产养殖病虫害防治产品、高效生物饲料及添加剂、营养剂、抗菌素等。
（二）加强渔业关键共性技术攻关，为建设现代渔业基地、全力推进渔民“双转”工作、实现海洋渔业的可持续发展提供支撑。
科技进步是发展海洋渔业的基础，加强渔业关键共性技术攻关，建设现代渔业基地、全力推进渔民“双转”工作等都要依靠科技进步。“十一五”期间，我市海洋渔业科技力争在新品种选育、新产品开发、新工艺和设备研制、效益养殖业、水产品精深加工、生物资源开发等方面实现突破。
1.水产养殖。
积极运用细胞工程、基因工程等高新技术，优化苗种品系，保护现有种质资源，提高养殖品种的生长率、存活率、抗逆性。大力推广多倍体育苗、工厂化育苗、高密度育苗等技术，巩固扩大虾、蟹育苗优势，加快贝、鱼类苗种基地建设，逐步形成主体品种、后备品种相配套的良种繁育推广体系。发展苗种品牌，形成具有我市特色的育苗产业。积极开展养殖设施、配合饲料、病害防治和健康养殖等共性关键技术研究，力争在养殖水产品安全及优质标准生产技术、深水网箱及其高效养殖技术、名特优水产品种“引、育、繁”及良种选育技术、主要养殖种类单养与多元养殖技术、海域滩涂综合开发利用技术、养殖产品质量安全和快速高效检测技术、渔药的安全使用技术等方面有所突破。
2.水产品加工。
围绕食品安全关键技术，开展食品质量安全加工生产技术研究和质量检测新技术研究，大力开发海产保健品和多功能水产食品。加强利用低值水产品和水产品加工废弃料生产功能食品、饮料、调味品等技术和海产品精深加工技术与装备、海产品保鲜保活技术与超低温加工装备的研究，并形成有重大经济效益的高科技海洋产业化项目。
3.海洋药物与生物技术。
以海洋精细化工品、海洋药物为重点，研究、开发附加值和技术含量较高的生化制品、天然海产药物和保健食品，包括：生物多糖、生物多肽、生物糖蛋白等海产生物制品，高效、低毒副作用的抗心脑血管系统疾病药物，降血脂、抗衰老、抗肿瘤等药物，海产保健食品和化妆品。
4.海洋生物资源开发利用和保全。
重点加强对海洋生物资源、生态系统、水质监测、生物污染、生物资源构成及其数量变动规律、濒危物种和生物多样性保护等研究，力争在海洋生物养殖资源开发和可持续利用技术、滩涂围垦以及综合利用技术、蓝色食品开发利用技术，舟山渔场鱼类主要产卵场、肥育场的保全计划、保护技术，海洋生态荒漠化综合治理技术，人工增殖放流、生态修复技术等方面有新的突破。
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