自查自纠工作用半年左右时间完成，至2007年初基本结束。自查自纠的主要环节为：
1、进行宣传动员。各主抓牵头单位要结合各自的实际，制定工作方案，对本系统自查自纠工作的时间进度、工作步骤和方式方法等做出具体安排。通过动员部署，明确本系统本部门本单位自查自纠的工作要求，任务要具体明确，措施要切实可行。同时，要加大依法合规经营、反对商业贿赂的宣传和教育力度，提高对开展不正当交易行为自查自纠意义的认识，为这项工作营造良好的舆论氛围。
2、开展调查摸底。各主抓牵头单位要进行全面的摸底调查，掌握本系统不正当交易行为的主要手段、方法和特点，以及所涉及的单位、岗位、环节、人员、资金等基本情况。
3、查找突出问题。要通过运用审查营销费用、购销合同、清理建筑合同（副本）或补充协议及备忘录、土地出让招拍挂程序、查看领导班子和部门工作会议记录等方式方法，认真查找存在的突出问题。
企业事业等单位要重点查找经营决策、资产处置、资金调度、物资采购、市场营销中以及重点岗位人员的问题。（1）在商品（服务）购销中给予或收受不正当利益的行为；（2）在各类招标投标活动中，特别是在政府投资项目招标投标中的违规违法行为；（3）在国企改制和产权转让中违反《
企业国有产权转让管理暂行办法》等规定，暗箱操作，侵吞国有资产或造成国有资产流失的问题；（4）经营决策机制和内部规章制度可能产生或纵容商业贿赂的问题。
各行业主管（监管）部门要结合各自特点，通过对本行业不正当交易行为的表现形式、发生规律、特点等进行分析，认真查找下列重点问题：（1）机关及其工作人员利用职权参与或干预企业事业单位经营活动，谋取非法利益的行为；（2）在行政审批中索贿受贿的行为；（3）玩忽职守、失职渎职以及其他不履行市场监管职责，放任、纵容甚至包庇搞不正当交易的行为；（4）监管手段、方法和有关规章制度存在的缺陷或不足；（5）违反统一市场原则或国家统一规定，擅自设置准入门槛或搞地方保护。
各主抓牵头单位可以结合实际，在认真查找上述重点问题的同时，选择确定本系统自查自纠的其他重点问题。
4、分类作出处理。对查找出的不正当交易问题，各主管（监管）部门和各企业事业单位要按照工作和业务范围、干部管理权限，依纪依法、实事求是地作出处理。要根据事实、情节、后果，以及认错态度等，予以区别对待。（1）对情节轻微的，以批评教育和自我纠正为主；（2）对情节严重，但在自查自纠期间能主动说清问题并认识和纠正错误的，依据有关规定从轻、减轻或免予处分；（3）对拒不自查自纠、弄虚作假或掩盖违规违纪违法问题的，一经发现，从严处理；（4）对行业中普遍存在的问题，要结合纠风工作进行治理；（5）对涉嫌违法犯罪的，要移送行政执法部门和司法机关处理。
