（1）对过境水的依赖程度极高。
蓄水工程兴利库容占径流量的比重不大，而且大部分分布在偏远的山区，人口和用水集中的中心城市地区缺乏可建蓄水工程的自然条件，对过境江水的依赖程度极高，鹤山、蓬江、江海、新会都靠取用西江过境水，没有备用水源，水质污染的威胁很大，咸潮上溯对取水也产生不利影响；目前全市尚未建成有跨流域性的调水工程，未能高效利用水库水资源，水资源调配能力不强。
（2）水的有效利用率低。
2005年全市供水总量29.62亿立方米，地表水源、地下水源分别占97.8%、2.2%。农业灌溉用水占用水总量的51.8%；按生产、生活、生态分类，三者用水量分别占92.3％、7.4％和0.3％；全市水资源利用率为27.1％。农业是水资源的最大用户，农业灌溉大多采用大水漫灌，节水水平低，有效利用率平均只有50%左右，工业用水重复利用率还不高，只有50%左右。
（3）水污染较严重。
工业废水，生活污水，农业农药、化肥以及水土流失等，造成水环境不断恶化，水污染较严重。用水量大产生的最直接结果是废污水大量排放，2004年排放量达6.97亿立方米，大量废污水不能达到排放标准；城市污水处理设施建设严重滞后，污水处理率低，至2005年，全市已建成污水处理厂污水日处理能力只有11万吨；水环境质量不断恶化，部分原来作为饮用水源的河段丧失了使用功能，城市内河涌甚至发黑发臭，导致了可利用水资源的减少。
（4）水价低廉，水利简单再生产难以维持。
水利工程效益的一个显著特点是社会效益大，直接经济效益小。如防洪工程社会效益很大，而本身没有财务收益；灌溉效益也很大，但水费低廉且收取率低，造成本部门财务收益为负值，连运行维护都难以得到保证；对水资源费征收标准平均只有0.02元/t，水资源费标准低，客观上助长了浪费水资源、增加排污量的现象，不利于水资源的管理。
（5）管理机制不够健全。
按《
中华人民共和国水法》规定，水权为国家所有，由水行政主管部门代表国家行使管理权。但在产权的具体实现和管理上，却是分散、混乱的，这是水资源开源节流及水体污染防治难以奏效的一个重要原因。按目前的体制，在水资源的管理上，基本上还是多部门“涉水”管理，水利、环保、市政、建设等部门职能存在交叉，存在“部门分割”，管理机制不健全，事实上未能实现对水资源在供、用、排等方面的统一管理。
2、水利建设存在问题。
（1）水利资金投入不足。
“十五”期间，按有关水利政策法规收费，水利建设投资比过去有了较大增长，鉴于我市各级财力有限，水利建设配套资金需要量大，仍有一些政策法规尚未得到有效贯彻落实。一些用水大户多年来都拒交水资源费，导致水资源费征收无法顺利进行。鉴于地方财力所限，各级财政对水利投资与实际需求差距仍较大。水利是国民经济的基础产业，主要以公益性社会效益为主。此类项目投资者一般不愿进行投资，主要由受益者和政府共同承担。
（2）部分计划工程项目不够合理。“十五”规划考虑面广、工作量大，重点不够突出，规划项目超出当地实际财力的承受能力，在规划执行的时候无法全面完成任务。
