在科技攻关发展目标方面，继续在动植物品种选育与特色农畜产品加工、高原生物资源开发、藏医与藏药开发、新能源利用、重要矿产资源勘查与开发、生态环境监测与保护等重点领域组织联合攻关，力争在上述领域取得新的突破；到2010年，开发具有自主知识产权的藏药新药3～5种，特色农作物品种3～4个，优良畜禽品种2～3个，力争3～5项研究成果获国家级科学技术奖励。
在科技能力建设目标方面，培养一批高素质的科技创新人才，逐步建立结构合理的科技人才队伍；科技人才年增长率继续保持4.5%，2010年全区科技人才总量达到50000人，其中工程技术人员6000人，农业技术人员2000人，科学研究人员600人。加强各级科技管理机构和科研院所的基础设施建设和科技资源共享平台建设，建设农牧业技术推广体系、科技研发与成果转化示范中心，逐步完善技术推广、资源共享和研究开发三大平台；努力提高全民科学素养，使80%的农牧民掌握一门实用技术。
（二）2011-2020年发展目标
逐步建立和发展以企业、科研单位和高校为主体的科技创新体系。创造有利于科技创新和创业的社会环境，建立一定数量的素质高、信誉好、面向市场的科技中介服务机构；建立一批特色优势显著、国内外有影响的科技研发与技术推广机构。
2020年全区科技人员总量达到80000人，其中工程技术人员10000人、农业技术人员5000人、科学研究人员2000人。逐步调整人才结构，培养一批区内外有影响的学术带头人。进一步加强各级科技管理机构和科研院所的基础设施建设，不断完善技术推广、资源共享、科技研发三大平台。全社会的科技意识和科技素质有很大提高。
科技创新能力有较大提高，到2020年，在特色农牧业、特色生物资源、藏医与藏药开发、新能源利用、重要矿产资源开发、生态环境保护与建设等重点领域取得30余项具有自主知识产权的重大科技成果。
科学技术对全区国民经济增长的贡献率有显著提高，其中农牧业科技进步贡献率达到55%，高新技术产业增加值占工业增加值的比重达到50%。科技综合实力上一个新台阶。
四、重点领域及其优先主题
根据经济社会发展的需求，确定高原特色农牧业、生物资源、藏医与藏药、新能源、优势矿产资源、传统工业与高新技术产业、旅游业、水资源、生态建设与环境保护、自然灾害预防、经济社会可持续发展研究、信息化与现代服务业体系建设等12个重点领域、48个优先主题。
（一）高原特色农牧业
高原特色农牧业科技近年来有了巨大进步，紧紧围绕农牧业经济结构调整和农牧民增收，开展了农作物品种选育、畜种改良和20多种实用新技术的引进、创新与示范推广工作，农作物单产、总产和畜牧业生产效率大幅度提高，对促进农牧区发展、提高农牧民收入、保障我区粮食安全发挥了重要作用。但依然存在生产科技含量低、产业化发展水平及产品附加值低等问题，制约农牧业可持续发展。
发展思路：
紧紧围绕第一产业上水平的要求，加强农牧业技术集成和配套，突破主要农畜品种改良和高效生产、动植物疫病控制的关键技术，提高农产品质量；发展特色农牧产品精深加工关键技术，延长农牧业产业链，提高产业化水平和综合效益；加速农牧业科技成果转化，大幅度提升产业技术竞争能力和自我发展能力；推动科技富民强县等科技工程，为农牧业可持续发展和社会主义新农村建设提供支撑。
优先主题：
1．特色农畜品种选育与遗传资源保护利用研究
强化生物技术育种与常规育种方法相结合，重点开展青稞、油菜、马铃薯、荞麦、牦牛、绒山羊、藏系绵羊等优质高产高效农畜品种的选育、改良和繁育技术研究；利用生物技术，培育综合性状优良、适应高原环境的特色农畜新品种；研发特色作物与畜禽的遗传资源保护技术与规模化、集约化种养殖技术；高原特色经济林木的选育，非木质品森林资源的研究开发。
2．农畜产品深加工及综合利用关键技术开发
研究开发以青稞、牦牛等为原料的特色食品；研究青稞、牦牛的产品加工技术、副产品综合利用关键技术和生态型储运技术等；开展动植物安全生产与食品安全诊断和保障研究。
3．生态农业综合技术体系研究
开展资源节约型、环境友好型生态农牧业、循环型农牧业的系统结构与关键技术研究；开展设施农牧业关键技术与管理措施研究；开展草原植被恢复与建设关键技术研究；开展以无公害蔬菜、特色果树和花卉等为主的栽培技术研究。
4．区域农牧业结构调整与特色产业发展研究、示范、推广
开展农牧业区域布局与特色产业带发展、作物种植结构调整、集约化耕作制度研究；开展饲草饲料生产加工研究，重点开展牛、羊、猪、禽高效养殖饲料研制；开展城郊、农区与草原畜牧业结构调整研究，重点开展以北繁南育和特色种畜开发为核心的农牧结合研究，引进开发农区畜牧业丰产增效新途径与新技术、牦牛舍饲半舍饲技术。
5．农牧业科技示范工程建设
