探索实施市级公立医疗机构“管办分离”改革。在深化卫生投融资改革的基础上，成立了上海申康医院发展中心。“管办分离”后，市卫生局作为主管全市卫生工作的政府组成部门，强化卫生全行业管理、强化政府公共卫生服务、强化医学科研和教育。上海申康医院发展中心作为市级公立医疗机构国有资产营运与管理的责任主体和政府办医的责任主体，在市卫生局行业管理下，执行卫生和国资部门的政策、方针、规划，履行出资人资产权益，推进市级公立医疗机构改革，确保正确办医方向。
二、主要问题
（一）卫生事业发展存在体制性和结构性问题，卫生事业发展不平衡。卫生事业与经济社会协调发展的体制、机制尚不健全，与经济社会发展的互动促进作用未充分显现。卫生事业发展存在一些结构性问题，城乡卫生事业发展、医疗与预防、中医与西医发展不均衡。
（二）城市公共卫生安全存在各种潜在威胁。上海作为国际性的特大型城市，人口基数大、密度高、国内外人流物流交往频繁，各类自然灾害、事故灾难、包括新发传染病在内的突发公共卫生事件和突发社会安全事件，尤其是国际上出现的生物、核化等各类恐怖活动，都对上海的公共卫生安全造成潜在威胁。2010年上海将举办“世博会”，对传染病防治、医疗急救和医疗保障等提出了新的挑战。进一步完善公共卫生体系，提高应对突发公共卫生事件和预防控制重点疾病的能力，确保城市公共卫生安全将是“十一五”期间上海卫生系统面临的重大任务。
（三）城市布局调整、人口老龄化和疾病谱转变对卫生服务带来新的挑战。“十一五”期间，上海城市布局将进一步完善，人口分布将不断调整，预测到“十一五”期末，上海常住人口总量控制在1900万左右，卫生资源的布局和可及性需要进一步改善。同时，上海人口老龄化和高龄化程度也将不断提高，人群疾病谱转变速度明显加快，心脑血管疾病、糖尿病、肿瘤、损伤和中毒、精神和心理疾病等将成为影响居民健康的主要危害因素，慢性病防治任务将日益加重。
（四）基本医疗服务的供给与人民群众的需求存在一定差距。人民群众日益增长的医疗服务需求与政府财政承受能力、个人支付能力相对不足的矛盾较为突出。医疗服务费用增长较快，部分低收入和低保障、无保障人群的“看病贵”问题比较突出。公立医疗机构的补偿机制和运行机制不完全合理，基本医疗服务的质量和效率有待提高。
（五）现代医疗服务业有待加快发展。“十一五”期间，伴随着上海经济快速发展和对外开放的进一步扩大，上海的外籍人士数量和高收入人群将进一步增加，多层次、多样化、延伸性的医疗和保健服务需求日益凸现。上海同时承担着服务长三角、服务长江流域、服务全国和增强城市国际竞争力，面向世界，打造亚洲医疗中心城市的任务，都要求加快发展现代医疗服务业，大力提升上海的医疗服务辐射能力，满足多层次、多样化医疗服务需求。
三、指导思想
以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面贯彻落实科学发展观，紧紧围绕增强城市国际竞争力这一发展主线，贯彻新时期卫生工作方针，按照“确保公益、促进均衡、注重内涵、激发活力”的原则，深化改革，加强管理，促进卫生事业全面、协调、可持续发展，为上海建设“四个中心”、成功举办“世博会”、实现“四个率先”和经济社会又好又快发展作出贡献。
1、坚持以人为本，把保护人民健康放在第一位，以提高人民健康水平和维护人民健康权益作为卫生工作的根本出发点和落脚点。
2、坚持卫生事业发展与城市功能、经济发展、社会需求、人文理念相协调，实现卫生事业与经济社会相互促进、互为保障、协调发展。
3、坚持公共医疗卫生的公益性质。卫生事业是政府实行一定福利政策的社会公益事业，实行政府主导和引入市场机制相结合，走符合中国国情和上海特点的发展道路。
4、坚持预防为主，中西医并重，切实把工作重心转向基本、转向社区、转向郊区，优先保证覆盖城乡居民的公共卫生服务和基本医疗服务。
5、坚持以科技和人才作为发展的核心推动力，发挥科技第一生产力、人才第一资源的巨大推动作用，为卫生改革与发展提供坚实支撑。
6、坚持与时俱进、开拓创新，强化政府责任，深化医疗卫生体制改革，破除制约发展的体制机制瓶颈，提升卫生系统物质文明和精神文明建设水平，促进卫生事业健康发展。
四、发展目标
