清查的目的：通过对城乡国家、集体、个人非农业用地的清查，掌握清查范围内正常占用和非正常占用土地的情况，坚决刹住乱占滥用耕地的歪风，为进行土地登记，颁发土地使用证，建立地籍管理制度，制定各项基本建设用地和个人建房用地的年度控制指标，以及为国家征收土地税和土地使用费，提供客观依据。
清查的范围：⑴国家、集体建设用地，包括占地总面积，占地总面积内各种建筑用地、活动场地、绿化用地面积等；⑵个人建房用地，包括住房、杂屋、固定牲畜栏圈、厕所、有固定围墙的庭院和专业户非农业用地。
对一九八二年以来的非农业建设用地的清查结束以后，要及时转入对一九八二年以前的非农业建设用地的清查。起步较晚的地方，可以对一九八二年前后的非农业用地同时进行清查。
二、加强对清查工作的领导
地、州、市、县(市)分管土地管理工作的负责同志要亲自抓，日常工作由各级土地管理部门负责。清查工作还没有开始或刚刚开始的地方，应立即成立有县(市)领导参加的清查领导小组，并以土地管理部门为主抽调力量组成清查办公室，把这项工作迅速开展起来；清查工作进展缓慢的地方，当地政府要采取积极措施，加快清查进度，清查工作基本结束或即将结束的地方，要搞好检查验收，消灭死角，并认真做好资料整理、土地登记发证等后续工作，逐步建立健全土地管理制度。
城市建设用地的清查，各地要抓紧进行。铁路、农场、林场、大型厂矿企业等单位建设用地的清查，当地政府要统一部署，加强指导，一般可先由单位自清自查，然后将清查结果报送当地政府土地管理部门核实。手续齐备、权属清楚的，可核发土地使用证。
军队用地的清查，按人民解放军总参谋部、总政治部、总后勤部的规定进行。
三、认真处理违法占地问题
处理违法占地问题，要根据实事求是的原则，区别不同情况，做到宽严适度，既维护法律的严肃性，又合情合理。一要区别时间界限，即一九八二年国家颁布城乡建设用地两个办法以前的，一般可从宽处理；一九八二年以后，特别是一九八六年三月中共中央、国务院发出《通知》以后的，应依法从严处理。二要对违法占地的手段、数量、造成的影响及其态度进行具体分析，根据不同情况，作出不同处理。二要划清违法与犯罪的界限。一般越权审批或擅自占用土地的和一般的买卖、租赁土地，属于违法行为；借机受贿、贪污和买卖土地，牟取暴利的，属于犯罪行为。
