各类科研单位减少事业费拨款比例的核定，仍由其主管部门和同级科委按国家科委[87]国科发条字0422号文《关于
科研单位减少科学事业费拨款比例的核定办法》办理。
四、各类科研单位全年发放奖金的免税限额，放宽到人均四个半月基本工资。
金额预算管理的科研单位，奖金免税限额应以一个半月基本工资额为起点，这一个半月基本工资额可从事业费中列支，超过一个半月基本工资额部分，从奖励基金中列支，单位应本着“有钱则发，无钱不发，钱多多发，钱少少发”的原则，最高限额为人均四个半月基本工资额；差额预算管理及自收自支的科研单位发放的奖金，全部从奖励基金中列支，最高限额为人均四个半月基本工资额。全年发放奖金总额超过免税限额的部分，按规定征收奖金税。个人收入达到国家征税标准的，要按国家规定征收个人收入调节税。
五、对科研单位的收入征税，仍按财政部[86]财税字第081号文《关于科学技术研究机构收入征税的暂行规定》办理。对实行承包责任制的科研单位，其新办的生产、服务性企业取得的各项收入以及利用本单位技术、设备取得的服务收入(除广告、设计收入外)，在承包期内按合同规定需要在税收上给予照顾的，可按税法规定履行报批手续。对实行全额或差额预算管理的科研事业单位取得的事业收入，均按规定允许在扣除后的余额中计征能交基金。对经省科委批准，由财政拨付经费，独立从事科学研究的单位的科研设施自筹建设投资，免征建筑税。由科研机构兴办的科研生产经营实体，从投产经营之日起，区别情况，经批准减征或免征集体企业所得税一年，产品税、增值税、营业税应按规定交纳，个别确有困难的，可按管理权限报批，酌情减征照顾。科研机构同十七个贫困县联合兴办科技扶贫经济实体，从投产之日起，经批准免征产品税、增值税一年(财政部不准减税的产品除外)，营业税三年(商业经营除外)，对其分得的利润减半征收所得税五年，期满后，个别纳税确有困难的，按权限报批。
六、对事业费包干的科研单位，在合理定编定员的前提下，增人不增工资总额，减人不减工资总额。对减拨事业费的科研单位，准予自费搞浮动升级，自费对贡献突出的职工奖励晋级。自收自支单位，年奖励晋级面为百分之三；差额预算管理单位，事业费递减百分之五十以下的，年奖励晋级面为百分之一；递减达到百分之五十的，年奖励晋级面为百分之二；递减达到百分之百的；年奖励晋级面为百分之三。奖励晋升的工资，只在本单位享受，调出本单位无效。上级主管部门应批给相应的工资基金计划和奖励晋升指标。增资部分从本单位创收中列支，奖励晋升指标允许在三年内结转使用。
