第十八条 项目承担单位要严格按国家规定和项目合同预算规定范围开支使用，并按项目的进度控制用款，对不符合规定开支范围的经费使用，财务部门有权开支。
第十九条 建立科技三项费用的决算管理制度。科技三项费用的决算分为年度决算和项目终结决算：
1、年度决算。每年年终由项目承担单位的财务部门对项目经费拨入、支出进行核算，于翌年1月20日前填写《广西壮族自治区科技三项费用决算报表》(附表1)，一式3份，报送自治区科委条件财务处。自治区科委于3月1日前向自治区财政厅汇总编报上年度的科技三项费用开支决算。
2、项目终结决算。由项目承担单位的财务部门在项目终结时，对项目经费的安排与使用进行决算，填写《广西壮族自治区科技三项费用项目终结决算表》(附表二)报送自治区科委条件财务处审核。未履行项目终结审核手续的项目，一律不予鉴定、验收。
第二十条 项目完成以后，项目承担单位必须及时清理，并区别不同情况进行处理：已完成并通过鉴定、验收后的项目结余经费，可撮不超过10%的经费作为对项目研究人员的奖励；属于按规定准予核销和有偿使用的部分，报经自治区科委、自治区财政厅批准后，冲销科技三项费用拨款；其余部分应作为国家投资，在资本公积金或固定基金中单独反映。
第二十一条 因故中途需要撤销或更改项目，在项目主管部门作出撤销或更改项目的决定后一个月内，项目承担单位必须作出经费清理决算，连同固定资产购置情况一并报送自治区科委、自治区财政厅核批。剩余的科技三项费用，全额上缴自治区科技三项费用专户，继续用于安排其他科技计划项目。
第二十二条 自治区财政厅要加强对科技三项费用使用的监督，进行定期或不定期的检查或委托审计，切实保证科技三项费用的专款专用。自治区科委对自治区财政厅进行科技三项费用使用的检查，要密切配合，及时提供有关帐表和资料。
第六章 奖罚
第二十三条 建立科技三项费用管理年度奖励制度，每年从财政科技三项费用预算拨款总额中提取1%的经费，用于奖励在科技三项费用管理、使用中成绩突出的单位和科技计划管理人员、财务人员。年度奖励办法由自治区财政厅和自治区科委共同制定，评奖的组织工作由自治区科委负责。
