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县(市、区)国税局税收管理科(股)收到征收部门报送的资料后，要认真审查，确认无误后在《申报表》(月报)“市(县)以上税务机关意见”栏中签署意见，加盖公章；同时，在退税资料中加盖“××县(市、区)国税局已审核”戳记。《申报表》第3联退县(市、区)国税局征税部门存档备查，《申报表》(第 1、2、4 联)及出口退税资料于月末10日前逐级退还生产企业。县(市、区)国税局征收部门可先按审核意见对生产企业办理免、抵税额和应纳税额或将未抵扣完的进项税额结转下期继续抵扣的手续。
(二)季度终了，生产企业应将出口及内销货物等情况按季汇总填报《申报表》(季报)，于季度末12日内将《申报表》(季报)及退税资料报送到县(市、区)国税局征收部门，仍按上述程序逐级审核签署意见。县(市、区)国税局税收管理部门应在季度末15日前将签署意见的《申报表》(季报)(共四联)、退税资料逐级退还给生产企业。
生产企业将签署意见的《申报表》(季报)及本季度的分月《申报表》、退税资料于季末18日前报送到市、地国税局进出口税收管理部门审核、审批。
市地国税局进出口税收部门(未设立专门机构的，由负责进出口业务的部门负责)收到生产企业按季报送的免、抵、退税申请及退税资料后，应认真审核。有出口退税审批权的市地，由市地进出口分局签署批准或变更免、抵税意见，并填写《生产企业出口货物免、抵、退税审批通知单》，连同《申报表》(季报)(第3、4联)下发到县(市、区)国税局税收管理科(股)，由税收管理科(股)发至县(市、区)国税局征收部门。没有出口退税审批权的市地，由市地负责进出口业务的部门在申报表“负责审核的退税机关意见”栏签署意见，于季末22日前报省局审批，由省局签发《生产企业出口货物免、抵、退税审批通知单》，并按上述程序逐级下发到县(市、区)国税局征收部门。县(市、区)国税局征收部门收到市、地局进出口税收部门和省局签发的《生产企业出口货物免、抵、退税审批单》等材料后，应及时根据审批意见对已办免、抵税和已征税情况予以确认或调整。
办理免、抵税后仍需退税的，由进出口税收管理部门按照有关规定直接开具《收入退还书》办理退税。
外商投资企业由县(市、区)国税局涉外征收部门、市地局涉外科负责逐级审核，签署意见。有审批权的市地，由县(市、区)国税局涉外征收部门报送到市地局涉外科，由涉外科报送到同级进出口部门审批。没有审批权的市地，由市地局涉外科复核后，于季末22日前报送到省局涉外处，由涉外处送省局进出口处审批。
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