4、主管税务所在指定的时间前对需换“千元版”的企业进行增值税专用发票内部清理。清理内容为：该企业领购、使用增值税专用发票期间全部购买数、验旧供新的领购使用数、未使用完的空白发票的结存数(见存根回收记录栏)，核对无误后，造具清单，并签上核对人和复核人的姓名，作为变更的依据。
5、换用“千元版”的企业，经核定一般纳税人领用的“增值税专用发票领用申请单”或记录的明细账和主管税务所造具的清单数字相同后，发票科或稽管科方能在需换“千元版”的企业填写好的“上海市清理、销毁空白发票登记表”上签收。
6、主管税务所应根据“上海市清理、销毁空白发票登记表”上所列的整本数号码和用剩部分的发票号码进行核对。核对正确后把增值税专用发票的代码和发票号码按顺序粘贴在“登记表”上 ，在交销人当面对监制章进行破坏性销毁，并在一式四份的“登记表”上签上二人以上的监交人姓名，加盖所章后，一份退交销企业，把截角、剪号的整本和用剩的空白增值税专用发票发票联、抵扣联及三份“登记表”(包括粘贴代码、发票号码的一份)装袋交发票科或稽管科。
7、发票科或稽管科在收到主管税务所交的空白增值税专用发票时，先对发票的真伪作鉴定，而后对“登记表”上粘贴的代码、发票号码和内部清单进行复点。确认无误后，在一式三份的“登记表”上签上二名以上的监销人的姓名，并加盖发票科或稽管科章。留发票科或稽管科粘贴号码的一份“登记表”作为留存归档。一份作为输入发票管理系统和在“发票购用印制簿”作销毁记录的依据，并填写发票名称、代码、起讫号码、份数、二名监销人姓名、销毁方式、再加盖印章。一份交主管税务所，按清理先后顺序装订成册，作为税务所留存备查。在清理中发现问题或不符要求的，即通知主管税务所向换“千元版”企业收回“登记表”，进行重新清理。
8、各主管税务机关在发票清理、销毁完毕后，须在“发票购用印制簿”上作好标记，即在税务机关加盖有关印章栏中，加盖“可购千元版增值税专用发票”长方形章和起购日期，对增值税一般纳税人确定使用“千元版”增值税专用发票的，必须在“发票购用印制簿”上加盖“可购千元版增值税专用发票”的长为5cm、宽为2cm的长方形章，并在发售处的电脑和分户账上作好记录。
四、“千元版”专用发票的供应办法
1、注册地和经营地同一的商贸型企业，每次只能供应1本，经一个月的实际使用本数，从严核实以后核定月供应量的控制数。
