(一)指导思想
实施科技型中小企业技术创新工程，要以市场为导向，以企业为主体，以我市特有的科技优势和全国的科技资源为依托，以提高企业竞争力为目标，通过产学研联合，促进技术创新机制的形成，加速高新技术成果向现实生产力的转化，加快经济结构与产业结构的调整的优化。
(二)总体目标
2000年起正式实施南京市科技型中小企业技术创新工程，到2005年全市科技型中小企业的高新技术产品产业化规模处于国内领先水平，重点领域产品的总体技术水平达到国际九十年代水平，在产学研联合上有新的突破，在技术创新能力、产品开发能力、市场竞争能力、可持续发展能力等方面得到明显增强，产品特色鲜明、科技含量高，市场竞争优势强，经济效益显著。
(三)具体目标
到2005年科技型中小企业技术创新工程要达到以下目标：
1、重点开发具有国内先进水平、市场竞争力强的新产品50项，每个产品年销售额达到1000万元以上；
2、培育壮大“技术创新重点企业”50家，销售总额达到25亿元；
3、组织实施30项重大科技成果项目的转化和产业化，取得较大的经济效益；
4、建成30个产学研结合的企业工程技术中心，全面增强科技型中小企业的技术创新能力。
三、主要任务和重点工作
(一)重点发展方向
重点培育电子信息、生物工程与医药产业中的计算机及相关设备、通讯设备、数字化视听产品、专用信息应用设备、新型元器件、软件与系统集成、生物生化药物、化学合成药物及中间体、天然资源药物及中间体、新型医疗器械、农药及畜禽类药12大类高新技术产品群，以及光机电一体化、新材料领域的新产品。大力开发推广对传统产业升级起关键作用、有共性的高新技术。
(二)主要任务
1、以开展高新技术为龙头，壮大技术创新重点企业。
——2000年建成以重点项目为龙头，销售额达5000万元的技术创新重点企业5家；
——2005年共建成以重点项目为龙头，销售额达5000万元的技术创新重点企业30家。
2、促进科技型中小企业成为技术创新的主体，加强与大专院校、科研院所共建“企业工程技术中心”等技术开发机构。
3、积极引进先进适用、市场急需的高新技术成果，加大转化力度，形成企业新的经济增长点。
——2000年组织实施重大科技成果转化和产业化项目5项；
