(一)各级行政事业单位自查自纠。普查表统一由厦门市土地房产管理局的各房屋管理所发放。普查表一式六份，填报单位留存一份，其余五份填写完毕后缴至各房屋管理所。
(二)自查出的应补税费，除补缴应纳税费外，不予加收滞纳金及处以罚款。重点复核中发现应报未报的，按《税收征管法》的有关规定处理。
(三)各单位自查结束后30日内到市地税局办税大厅(税保大厦三楼)补办税务登记证；市级行政事业单位应补税款在地税直征局征收入库；区、街道(镇)行政事业单位应补税款在各区地方税务局征收入库。
(四)各单位应补交的资产占用费(或房屋租赁收益金)统一使用《厦门市预算外资金缴款书》缴交至市财政专户。
(五)自查结束后，由市地税局、国资局、财政局、土房局、监察局组成复查小组进行复核，市级行政事业单位由市级复核小组为主复核；区、街道(镇)行政事业单位由各区级复核小组为主复核。除补缴应纳税费外，涉及设立“小金库”等其他非涉税违章行为的，由市财政局、市国资局、市监察局处理。
六、总结整改阶段在自查、复核后，将行政事业单位的“非转经”纳入正常税费征管，办理税务登记证，按税法规定缴纳税款：收入纳入各级财政预算管理，并将普查情况汇总书面上报市政府。
(一)2000年起“非转经”房屋相关税收应按规定申报期到各级地税机关申报纳税。自用房产房产税每半年申报一次，分别于3月和9月申报；出租房产房产税按月于月后15日内随营业税一并申报，同时开具“房租收入专用发票”入账。
(二)“非转经”的年检和国有资产占用费的缴交。普查结束后，由市国资局、财政局、土地房产管理局联合对行政事业单位“非转经”的房地产进行2000年的年检，年检的同时各行政事业单位有“非转经”房屋的要一并缴纳国有资产占用费。年检时间、地点另行通知。
七、普查要求：
(一)统一认识，将普查工作作为落实党风廉政建设责任制的一项内容。各单位要高度重视，将此次普查列入今年廉政建设责任制的一项重要内容，对不认真组织自查自纠的，或有问题不检查上报的，将按技制度和纪律追究相关单位主要领导及有关人员责任。
(二)如实申报、不得隐瞒。各单位必须指定专人负责，逐项填报《厦门市行政事业单位“非转经”房产情况调查表》，必须做到顶目齐全、数据准确、报送及时。填写后的调查表要在单位中张贴公布，接受群众监督，并于6月25日前报送。
