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负责厅机关和直属单位的人事和机构编制管理工作。
(三)政策法规与体制改革处
研究拟定繁荣全省科技事业、推动科技与经济、社会发展结合的政策和措施；研究制订科技体制改革的具体规划和政策措施，指导、推动省直各部门、各市地科研单位的体制改革工作；研究起草地方科技法规、规章草案和科技规范性文件，研究提出加强有关科技知识产权保护、技术合同仲裁、科技咨询等工作的政策措施；研究科技人员有关政策，推动科技管理干部培训及科普工作；开展软科学研究；编纂河南科技史志。
(四)发展计划处
研究全省科技发展战略，编制全省中长期科技发展规划和年度计划；组织编制全省各项科技发展计划、科技开发计划指南和省工程技术中心等科技基地组建计划；提出全省各项科技计划的协调、综合平衡和经费配置的建议；研究多渠道增加科技投入的措施；负责编制归口管理的科学事业费、科技“三项费”、科技专项经费、科技发展基金等有关费用的预、决算；负责科技统计工作；对科研机构的组建和调整进行审核。
(五)条件财务处
负责省级科学事业费的预、决算，对科学事业费的使用、管理进行监督、检查；研究科研条件保障方面的政策、措施和规划；规划并指导省重点实验室建设；管理科技期刊；编制和管理厅机关和直属单位的基本建设计划，负责厅机关的财务管理，管理厅机关和直属单位的国有资产。
(六)国际合作处
研究拟定本省国际科技合作的政策、措施及有关规章、制度，负责管理全省国际科技合作与交流工作；编制全省国际科技合作计划及项目并组织实施；代省政府审批出国科技人员及科技团组；负责对外科技宣传。
(七)高新技术发展及产业化处
研究提出全省工业领域高新技术发展及产业化的政策，组织拟定工业领域高新技术发展规划和计划；组织实施高新技术研究发展计划及全省工业领域重大科技攻关计划和科技创新工程；负责省级高新技术开发区的有关工作，协同有关部门推动全省工业科技进步，推动全省工业领域的科技体制改革和生产力促进中心等技术服务体系建设。承担省高新技术产业发展领导小组办公室的日常工作。
(八)农村科技处
研究全省科技促进农村发展的政策、措施；组织实施农村发展方面的重大科技攻关计划；指导农村重大科技产业的示范；指导农村科技服务体系建设、科技扶贫等涉及农村的科技工作。
(九)基础研究与科技成果管理处(挂河南省技术市场管理办公室牌子)
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