(四)组织指导全省森林资源清查、动态监测、评价和统计；组织编制全省森林采伐限额，经国务院批准后监督执行；管理和监督木材、竹材凭证采伐；管理和监督木材、竹材和松香产品凭证运输；指导乡镇林业站的建设和管理；组织指导全省林地、林权管理；按照国家有关规定负责征用。占用林地的审核或初审，以及监督、指导有关费用的征收和管理；指导、监督森林、林木、林地使用权的流转。
(五)指导、协调和检查监督全省森林防火和森林病虫鼠害防治、检疫工作；承担省护林防火指挥部办公室的工作；协调武警云南省森林总队的有关业务工作。
(六)管理国家和省级森林和野生动物类型自然保护区；组织、建立地州市县级森林和野生动物类型自然保护区并指导其开展工作；组织、指导、监督、管理全省陆生野生动物、植物资源的保护、开发和合理经营利用；拟定本省重点保护的野生动物名录和珍贵树种名录，报省政府批准后公布并组织实施；负责濒危物种进出口管理以及国家保护的野生动物、珍稀树种、珍稀野生植物及其产品的出口审批工作。
(七)负责指导全省森林公安工作和队伍建设；查处破坏森林资源和野生动植物资源的重大案件；指导林区治安工作。
(八)对森林资源的开发利用，尤其是木材、竹材生产和经营加工以及林产化工、木浆造纸、森林旅游、木本油料、木本药材、林木花卉等实行宏观管理。
(九)按照国家规定，进行林业重大基建和技改项目的研究、设计、预审和报批，指导林业基本建设。
(十)负责林业资金的管理和监督；指导、监督有关林业规费的征收使用和管理；负责厅属单位国有资产管理；负责对厅机关和直属系统的内部审计工作。
(十一)组织、指导全省农村改灶节柴、推广使用沼气等农村能源建设工作；推广木材的节约代用。
(十二)管理林业科技、教育和外事外经工作。
(十三)负责厅机关和直属单位的人事管理工作和党群工作。
(十四)承办省委、省政府和上级机关交办的其他工作。
三、内设机构
根据上述主要职责，云南省林业厅设8个职能处(室)：
(一)办公室
协助厅领导组织协调机关日常工作，拟定和监督执行厅机关的各项议事规则和工作制度；承办文秘、档案、会议、文印、信息、督查、信访、保卫、保密、编志、议案提案办理等工作；负责机关财务、资产等行政管理工作；指导林业系统涉外工作；承办外事接待及其他外事外经工作。
