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编制全省卫生事业发展规划，指导区域卫生规划工作，统筹规划与协调全省卫生资源配置；编制省级卫生财务预算、决算，对卫生事业经费使用进行监督管理；管理厅直属单位的财务工作和国有资产；监督厅直属单位基建年度计划的执行；负责全省医疗卫生机构服务价格管理、监督工作；组织实施国家卫生装备标准，审批全省大型医用设备；负责编制全省基层医疗单位基本建设、装备计划并监督实施；协调利用国外贷款的工作。
(四)卫生法制与监督处(省卫生监督局)
拟订全省卫生立法规划，组织协调地方卫生法规、技术规范、标准的拟定工作并监督实施；负责卫生行政复议和对卫生执法的监督；监督管理传染病防治和食品、职业、环境、放射、学校卫生；监督实施食品、化妆品、消毒产品、保健用品等与健康相关产品质量管理规范并负责认证工作。
(五)基层卫生与妇幼保健处
拟订全省农村卫生、社区卫生服务发展规划和服务标准，组织初级卫生保健规划的实施；指导城市基层卫生服务体系的改革，拟订全省妇幼卫生和提高出生人口素质工作的发展规划、政策措施和技术标准；监督母婴保健专项技术的实施；负责全省妇幼卫生工作的行业管理和业务指导，统筹协调健康教育工作。
(六)医政处
组织全省医疗机构改革，制订全省医疗机构发展规划、管理政策、办法和机构标准、执业标准、执业资格、服务规范并监督实施；监督医疗机构的医疗质量和服务质量，负责医疗机构内部药事工作和新药；临床研究基地的监督管理；依法监督管理血站、单采血浆站的采供血及临床用血质量；负责全省医疗急救，协助有关部门对重大人员伤亡事件组织紧急救护；负责医疗纠纷、医疗事故的处理工作。
(七)疾病控制处(省爱国卫生运动委员会办公室)
拟订全省传染病、慢性非传染性疾病及与公共卫生相关疾病的防治规划和措施，组织对重大传染病的综合防治；组织调度技术力量，对突发疫情、病情实施紧急处置，防止和控制疫情、疾病的发生和蔓延；负责计划免疫工作；承办省爱国卫生运动委员会的日常工作。
(八)科技教育处
研究拟定全省重点医学科技发展规划，确定我省卫生科技优先发展领域，拟定我省医学基础研究、重大疾病研究、应用研究政策和措施，组织研究医学卫生技术标准；组织医药卫生科研攻关，负责医学新技术引进和推广；负责卫生科技交流；拟定全省医学教育发展规划和成人医学教育、继续教育管理办法，指导高中等医学教育和省属医学院校的教学工作。
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