清查处理工作以市、县为单位，按统一部署和要求组织实施。清查处理工作分两个阶段进行：
(一)宣传发动、调查摸底和自查自纠阶段(9月28日-10月25日)。
各市、县要按照全省统一部署，开展土地管理法律、法规的宣传教育活动，组建清查队伍，结合本市、县具体情况，研究制定工作方案，统一操作方法，编制清查表格，下发各乡、镇和用地单位，规定填报时间和要求。
同时，要对清查范围内的农业开发用地逐宗进行调查摸底，并统一登记造册，建立宗地档案。在调查摸底的基础上，市、县政府根据有关法律、法规的规定，制定清查处理的办法，对清查出来的问题，要依照国家的有关法律、法规及本行的有关规定进行认真处理。
(二)检查验收和整改建制阶段(10月25日至11月25日)。
各市、县在此阶段要完成清查统计汇总，编写清查工作总结，要通过清查工作，针对本市、县存在的主要问题，依照有关法律、法规，研究制定严格的管理措施。省政府将组织省上地、农业等有关部门，对各市、县的清查处理情况进行全面的检查验收，对清查处理结果不合格，成街隐报、瞒报、谎报清查结果的市、县给予通报批评，并限期整改。
四、清查要求和处理的原则
清查工作要严肃、认真、细致，处理问题要依法按程序进行，要正确处理好国家、集体、个人三者关系，既要依法保护土地权益人的合法权益，又要促进项目开发。要坚持“事实清楚。程序合法，适用法律准确，处理决定依法合理”的原则，并从以下几个方面入手：
(一)检查土地出让、出租、承包合同的履行情况。对没有按照合同规定期限动工开发的，要加大力度，监督开发商尽快投资开发利用土地，对闲置的土地，凡能复耕的，要限期复耕；满2年未开发的，要依法收回土地使用权(承包经营权)，重新安排使用。
(二)开发商资金落实，但项目地块不具备开发条件，或者不符合土地利用总体规划的，要重新调整，并限期开发。
(三)对原批准出让、出租、承包用地面积过大，造成部分土地闲置的，应根据资金落实情况，按有关规定予以核减。
(四)对超越权限发出的土地批文、红线图、土地证及其他承诺土地出让的合同、协议等有关文件，应予以废止。资金到位、项目可行的农业开发用地，可另按有关规定补办手续。
(五)擅自占地、圈地导致土地闲置的，要严格依照土地管理法律、法规及有关规定做出严肃处理。
