14、实行卫生工作全行业管理。逐步取消医疗机构与卫生行政部门的行政隶属关系，实行政事分开。
卫生行政部门要根据政府在卫生事业改革与发展中的职责和作用，切实转变职能，从“办卫生”转向“管卫生”，并强化在法制建设，规划与政策制定，公共卫生与基本医疗，信息管理与发布，基本建设与设备购置，国有资产监管，组织重大卫生科研等方面的职能。
合理划分卫生监督和卫生技术服务的职责，理顺、完善卫生监督体系，依法行使卫生行政监督职能，规范医疗行为，严厉打击非法行医和违法医药广告。
综合运用法律、行政、经济等手段，用1－2年时间剥离依附在国有企业内的各类医疗机构，把部、省属驻厦企业所办的医疗机构和对地方开放的军队医疗机构，统一纳入市区域卫生规划，实行卫生资源属地化管理。
15、实行医疗机构分类管理。根据
卫生部等四部委《关于城镇医疗机构分类管理的实施意见》把我市的医疗机构分为营利性和非营利性两类进行管理，并按程序进行核定，办理有关手续。
非营利性医疗机构在我市医疗服务体系中占主导地位，享受相应的税收优惠政策。政府举办的并承担基本医疗任务、在医疗服务体系中发挥主导作用的非营利性医疗机构，各级财政应予定额和定项补助，并按扣除财政补助和药品差价收入后的成本制定医疗服务价格；对原由政府举办转为非政府举办的非营利性医疗机构，可在其执业登记之日起，三年内视财力可能，对其符合市区域卫生规划配置要求的专项设备予以定项补助。要加强对非营利性医疗机构财务的监督。
营利性医疗机构依法自主经营，照章纳税。
当发生重大灾害、事故、疫情等特殊情况时，各类医疗机构均有执行政府指令性任务的社会义务。
16、转变公立医疗机构的运行机制。扩大公立医疗机构的自主权，实行公立医疗机构的自主管理。建立健全内部激励与制约机制，逐步形成符合卫生工作特点的政事分开、权责明晰、富有生机的公立医疗机构内部管理体制。
改革公立医疗机构人事管理制度。实现人员身份与单位脱离。编制与市区域卫生规划相适应的卫生人力资源配置标准，建立市人才市场卫生专业人才分市场，逐步推行人事代理制度，积极推行全员聘用制。逐步采用以公开竞争、择优聘任为主的多种形式任用医院院长，完善院长负责制，实行任期目标责任制管理；专业技术人员实行专业技术职务聘任制；医院管理人员实行职员制；工勤人员实行合同制。
加强岗位管理。建立以岗位责任制为中心的各项内部规章制度。严格执行医院技术服务标准，形成科学的岗位分类考核、业绩评估和奖惩制度。
