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(四)录入申报表相关数据
1、征收人员进入CTAIS系统一般纳税人申报界面，录入纳税人识别号和所属时期，系统判断纳税人是否防伪税控企业；纳税人是防伪税控企业但没有提交税控IC卡的，征收人员告知纳税人资料不齐不予受理申报；
2、抄税的同时，征收人员录入纳税人申报表主表及《增值税纳税申报表附列资料》中的“防伪税控系统开具的增值税专用发票”金额、税额和“本期认证相符且本期申报抵扣”金额、税额。
(五)“票表稽核”及相关处理
征收人员完成主表及附表相关数据录入，并确认税控IC卡抄税成功后，选择“保存/开票”按钮，系统自动访问防伪税控数据库，读取纳税人本期抄税数据，进行“票表稽核”。
1、稽核相符，系统稽核结果显示“通过”，征收人员点击“继续保存”按钮保存申报表进行开票扣款，将纳税人税控IC卡与其他申报资料退回纳税人，完成当期申报。
2、稽核不符，系统稽核结果显示“未通过”。征收人员应选择点击“返回”按钮返回申报界面，确认《增值税纳税申报表附列资料》等相关数据录入是否正确，如数据录入有误，可直接对数据进行更正，更正后再次进行“票表稽核”；对稽核仍未通过的，征收人员打印《信息表》(一式三联，第一联留存、第二、三联加盖征收章后交纳税人)，点击“继续保存”按钮保存申报表，进行开票扣款，同时暂扣纳税人税控IC卡，通知纳税人持退回的申报资料及《信息表》(第二、三联)到 “申报复核”窗口处理；
(六)申报复核
“申报复核”窗口复核人员根据纳税人提交的《信息表》(第二、三联)及已加盖征收章的申报表及其他资料进行复核。
1、属合理不符情形的，复核人员在《信息表》(第二、三联)作问题确认，加具退回税控IC卡意见，《信息表》(第二联)留存，通知纳税人持《信息表》(第三联)到“申报受理”窗口办退税控IC卡手续；
2、属应补申报纳税的，复核人员在《信息表》(第二、三联)作问题确认，出具意见(不选择确认“是否同意退IC卡”意见项)，《信息表》(第二联)留存，通知纳税人持《信息表》(第三联)到“申报受理”窗口补申报纳税；
“申报复核”窗口复核人员无法现场处理的，复核人员在《信息表》不加具意见，通知纳税人到管理科复核检查岗位处理。
(七)复核检查
管理科复核检查岗位根据纳税人提交的《信息表》(第二、三联)及已加盖征收章的申报表及其他资料进行检查、复核，检查复核完成后，在《信息表》(第二、三联)作问题确认，加具意见(属补申报纳税的，不选择确认“是否同意退IC卡”意见项)，《信息表》(第二联)留存，通知纳税人持《信息表》(第三联)到“申报受理”窗口办退税控IC卡或补申报纳税手续。
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