在维持现行管理局与计征局机构设置及职责分工的条件下，我市的“一窗式”窗口设置有两种模式。
(一)模式一，“两窗三人”
在并列的两个“申报受理”窗口中，两人(计征局征收岗位人员，以下称征收人员)分别临窗受理纳税人的纳税申报及税控IC卡报税资料，并负责处理纳税申报事宜；第三人(管理局税控IC卡抄报税岗位人员，以下简称抄税人员)在后台(或在中间、左右均可，下同)负责处理两个窗口接受的纳税人的税控IC卡报税事宜。具体流程为，两个窗口征收人员接收纳税人的纳税申报和税控IC卡报税资料后，将税控IC卡交后台抄税人员，由抄税人员在读卡器上完成插卡报税；税控IC卡报税成功后，税控IC卡退征收人员，征收人员处理纳税申报和“票表稽核”等事宜。
窗口计算机配置方式为，两个征收人员各配备一台PC机，处理纳税申报，并连接或共享打印机用于打印“票表稽核”不符情况；抄税人员配备一台装有税控读卡器的PC机。这种方式征收人员与抄税人员的配比为2：1。
(二)模式二，“一窗二人”
在一个“申报受理”窗口中，一人(征收人员)临窗受理纳税人的纳税申报及税控IC卡报税资料，并负责处理申报事宜；另一人(抄税人员)在后台，负责处理纳税人的税控IC卡报税事宜。具体流程为，窗口征收人员接收纳税申报和税控IC卡报税资料后，将税控IC卡交抄税人员；抄税人员在读卡器上完成插卡报税，报税成功后，将税控IC卡退征收人员；征收人员处理纳税申报，录入相关数据，保存申报表，进行“票表稽核”。
窗口计算机配置方式为，两个人员各配备一台PC机，并连接或共享打印机用于打印“票表稽核”不符情况，抄税人员配备一台装有税控读卡器的PC机。这种方式征收人员与抄税人员的配比为1：1。
以上两种模式均应设置“申报复核”窗口。对“票表稽核”不符的，由征收人员告知纳税人持相关资料到“申报复核”窗口处理。
三、管理流程
“一窗式”管理流程的要点为：税务机关在“申报受理”窗口统一受理税控IC卡报税和纳税申报，专用发票认证由管理局认证岗位人员直接在“申报受理”窗口受理。纳税人进入办税大厅后，直接到“申报受理”窗口递交纳税申报资料、税控IC卡，然后由“申报受理”窗口征收人员依照先操作税控IC卡报税，再操作纳税申报的顺序进行。在受理纳税人申报时，必须用防伪税控报税系统采集的专用发票存根联销项信息稽核纳税人申报的防伪税控系统开具的销项信息，同时用防伪税控认证系统采集的专用发票抵扣联进项信息稽核纳税人申报的防伪税控系统开具的进项信息，从而达到在申报系统中即时稽核的目的。
具体流程为：
