(一)卫生部门负责职业病防治工作的监督检查，受理所涉及的乡镇企业和农村个体工商户的职业病危害项目申报，督促其组织所用务工人员到指定的医疗机构进行职业病健康检查，开展有毒有害作业现场的监测，指导其建立职业卫生管理制度和职业病防治档案。对专项整治中发现疑似患有职业病的进城务工人员，认真组织好职业病诊断、鉴定和治疗，简化手续，方便进城务工人员就诊。对不符合职业卫生要求的，特别是未向卫生行政部门申报职业病危害项目、未组织劳动者进行职业健康检查、未向劳动者提供有效的个人防护用品、未配置职业病防护设施的，予以处罚；情节严重的，依法责令停业整顿，直至关闭。
(二)劳动保障部门负责劳动者权益、劳动合同和工伤保险工作的监督，强化劳动合同中的职业病防治内容，积极做好工伤保险工作，保障劳动者的工伤保险待遇，对未参加工伤保险的乡镇企业和有雇工的个体工商户，要督促用人单位按照工伤保险的政策规定支付待遇。对使用童工的用人单位或个人，责令其立即将童工送回原居住地，并由其承担所需费用，并依法予以处罚。对克扣或无故拖欠劳动者工资的，责令立即支持，并赔偿劳动者的损失。
(三)公安部门依法保障专项整治工作的顺利进行，对阻挠执法的企业和人员进行查处。
(四)农牧部门及乡镇企业管理部门负责乡镇企业管理的监督检查，与街道、乡镇和村委会一道，在卫生、劳动、安监、工商等职能部门的配合下，做好乡镇企业和农村个体工商户的清理排查、收集和汇总工作，及时向有关职能部门通报。
(五)工商行政部门负责对无照或超范围等违法经营行为进行查处，对在职业卫生、安全生产等方面存在问题的用人单位经整改符合条件后，予以办理或重新办理工商登记，不符合条件的，一律予以取缔。
(六)税务部门负责对纳税情况的监督检查，加强税收征管，严格查处逃税问题，对未依法纳税的，除追缴税款和滞纳金外，还要依法给予处罚。
(七)安监部门负责安全生产条件、安全生产设施及措施的监督检查，对造成生产安全事故(含职业病死亡)的，依法予以查处。
(八)环保部门负责环境污染的监督检查，对造成大气、水质等环境污染，给周边群众造成影响的，要依法予以查处，并限期整改。
(九)工会组织负责群众性劳动保护监督检查，积极开展进城务工人员权益保障宣传活动，为进城务工人员提供权利保护，结合实际帮助其建立工会组织；接受群众举报，提供整治线索，协助职能部门进行调查取证；督促业主按《
工会法》、《
职业病防治法》、《
劳动法》等的要求对其职工提供职业病健康检查、个人防护用品等权利。
