(一)自开票纳税人应自2004年1月纳税申报期开始，在申报时报送《自开票纳税人货物运输业发票清单》的纸质文件和电子信息。
(二)对经主管税务机关认定的代开票纳税人，应按期将不属代开票部分的营业收入向主管税务机关纳税申报，并出具代开票部分的完税凭证。
八、货物运输业发票汇总数据的网络传输
各区(县)税务局和财税分局应在每月22日前将汇总货物运输发票清单和增值税运输发票抵扣清单的电子信息通过MQ或FTP上传到市局，市局对本市发票进行比对后，将比对相符和不相符的发票情况下传给各分局，由分局传给征管和稽查部门，同时市局将跨省的发票信息以及比对相符和不相符信息全部上传到国家税务总局。另外，总局还将把外省市没有比对到和比对到的本市运输发票下传给市局，由市局再下传给各分局。具体上传办法和时间另行制定。
九、货物运输业发票电子信息采集软件的下载
纳税人使用的《自开票纳税人货物运输发票清单》和《增值税运输发票抵扣清单》的电子信息采集软件，可以通过以下四种办法免费获取：
(一)从国家税务总局网站(http：//www.chinatax.gov.cn)下载；
(二)从上海财税网站(http：//www.csj.sh.gov.cn)下载；
(三)从电子申报网站下载；
(四)对上网下载信息采集软件有困难的纳税人，自带软盘到主管税务机关拷贝采集软件。
十、电子信息的安全措施及系统的设备要求
由于接受纳税人的电子信息要通过各分局的局域网以及税务的广域网到市局，因此对计算机病毒要严格预防把关。市局要求对接受纳税人软盘的PC机必须要安装防病毒软件，在数据汇总上传市局前必须再次杀病毒，确保上传的数据无病毒。
运输发票数据汇总系统的设备要求：
硬件环境的最低配置，CPU：赛扬300、内存：64M、硬盘根据采集的发票信息量定。建议配置：CPU：PentiumⅢ以上，内存：128M。
操作系统WIN98/NT/ME/2000/XP平台。
十一、电子申报用户运输发票信息的报送方法
凡是参加电子报税的纳税人原则上不报送软盘，而是通过网站把采集的发票信息传送到分局，由分局统一汇总并进行杀毒后上传到市局。
加强货物运输业税收征收管理是当前一项重要工作，各分局应抓紧组织学习国家税务总局下发的有关文件的内容及本市的实施意见，结合各自的实际研究制定具体的操作实施办法。对执行中存在的问题，应及时与市局有关处室沟通，研究制定解决办法。在12月7日前将认定和发票清理工作等情况以书面形式报告市局，市局将对各分局的执行情况组织检查和考核。
