各级政府实行“政府负总责，部门各司其职”的动物防疫工作目标责任制。市政府每年与各区政府签订责任书，对各区落实责任制情况进行监督检查并考核。各区政府也要结合本区情况划定责任区，明确领导责任，狠抓责任落实。
1、市政府职责：领导全市区域内的动物防疫工作，加强对各区政府和各部门的监督协调。在发生一级重大动物疫情时，启动一级重大疫情控制应急预案，组织、协调有关部门支援，督促区级发布封锁令，及时控制和扑灭疫情。责成市农业部门制定村级动物防检员工作实施方案，制订防检疫计划并下达防检疫任务，加强对各区动物防疫工作的指导、检查、监督，加强对动物疫病的监测、分析，及时发现、控制和扑灭疫情，建立健全全市动物防疫工作制度；责成市计委、市财政、市审计等部门做好市级动物防疫物资储备、资金安排和监督等工作。
2、区政府职责
领导本辖区内的动物防疫工作，在发生二级重大动物疫情时，启动应急预案，负责发布封锁令，组织有关部门及时控制和扑灭疫情；制定镇、村动物防检疫工作目标责任制，落实定位、定岗、定额、定责、定酬的管理制度，负责村级动物防检员的选拔，通过把好选人关，把好用人关，把好管理关，解决待遇问题，做到疫病有人治、疫情有人报、免疫有人打、检疫有人做；区计委、财政、人事、编办等部门要做好区级动物防疫物资储备，落实各区镇、村动物防疫经费和村级动物防检员补助经费的配套，确保镇级畜牧兽医工作人员的到位，稳定动物防检疫监督机构。
3、镇政府职责：设立村级动物检疫申报点，为村级动物防检员的工作提供必要的条件和手段；负责督促辖区内村级动物防检员履行职责，实施辖区内的村级动物防检疫工作；在春防、秋防及重大动物疫情期间，通过镇畜牧兽医部门的牵头协调，实行“连片包干、联防联控”的办法，以行政村为基础单位，大村带小村及村居连片交通便利为原则，根据各行政村的畜禽养殖数量，以5-10个行政村为单位组成一个防检疫工作组，各村防检疫工作由各防检疫工作组统一负责组织实施。
4、村委会职责：村委会要督促村级防检员做好本行政村的动物产地检疫、动物疫病的免疫及登记建档和疫情报告工作；务必做到强制免疫密度达100%，检疫率达100%的目标。
四、队伍管理
(一)岗位设置：镇级动物检疫代检员、村级动物防疫员的岗位合二为一，统设“动物防检员”，每个行政村设立一名。
