财政专户或基金专用账户、支出户、收入过渡户原则上同一国有商业银行各开设一个账户。
第二十六条 财政专户或基金专用账户的主要用途是：接收“收入过渡户”的农村合作医疗基金收入；接收财政补助收入及其他收入；接收基金购买国家债券兑付的本息收入、该账户资金形成的利息收入以及支出户转入的利息收入等；根据经办机构的用款计划，向支出户拨付基金；购买国家债券。
第二十七条 财政专户或基金专用账户发生的利息收入直接计入该专户。支出户的利息收入从支出户定期转入财政专户或基金专用账户，具体时间由各地自定。
第二十八条 财政补助收入由国库直接划入财政专户或基金专用账户。
第二十九条 卫生、财政部门在双方共同协商的基础上，及时将基金按规定用于购买国家债券或转存定期存款。
第三十条 财政专户或基金专用账户的全部银行原始凭证复印后并加盖专用印章，交经办机构记账；实行基金专用账户管理的，同级财政需记备查账。第七章资产与负债第三十一条资产包括基金运行过程中形成的现金、银行存款（含收入过渡户存款）、财政专户存款或基金专用账户存款、支出户存款、债券投资、暂付款项等。
经办机构和乡镇代征机构应认真做好现金的保管、押送、管理工作，建立健全现金的内部控制制度。现金的收付和管理，要严格遵守《
现金管理暂行条例》有关规定。
经办机构应及时办理基金存储手续，按月与开户银行对账，同时，要做到经办机构、卫生部门、财政部门定期相互对账，保证账账、账款相符。
用基金购买的国家债券应视同货币资金，由财政或卫生部门妥善保管，确保账实相符。
暂付款项应定期清理，及时收回。
第三十二条 负债是指基金运行过程中形成的各种借入款项和暂收款项等，借入款项和暂收款项应定期清理，及时偿付。因债权人等特殊原因确实无法偿付的，经财政部门批准后并入基金。第八章基金决算第三十三条年度终了后，经办机构应根据规定的表式、时间和要求编制年度基金财务报告。财务报告包括资产负债表、收支表、有关附表以及财务情况说明书。
