（一）以人为本，结合省情，依靠基础、突破重点，解决严重影响人民群众健康的重大卫生科技问题。根据我省卫生工作实际，以严重影响人民群众身体健康和生命安全的重大疾病和重要卫生问题为重点，以具有一定研究基础和实践经验的疾病为主，组织全省科技力量进行攻关，力求在部分优势领域有所突破，有效解决部分重大医疗卫生问题，为社会发展提供健康保障。
（二）注重积累，加强创新，跟踪前沿，力求突破，提高卫生科技的综合实力，确保可持续发展。通过“十一五”期间的努力，逐步建立比较完善的卫生科技发展的基础条件和支撑体系，注重卫生科技的原始积累，提高自主创新能力，完善自主创新的体系建设，营造有利于科技创新的政策环境，紧跟国内外相关卫生科技发展前沿，加强前瞻性和基础性研究，力求在个别领域有所突破，建立稳步增长的卫生科研投入机制，奠定科学发展、可持续发展的基础。
（三）宏观指导，点面结合，优势互补，协调发展，实现卫生科技全面和谐的进步与发展。紧密结合我省经济社会发展以及卫生工作实际，以建立适合的公共卫生和医疗保障体系为根本目标，增强宏观指导和协调能力，整和与发挥现有的优势资源，有效促进公共卫生与医疗的协调发展、城乡卫生工作的协调发展、基础科技研究和应用研究的协调发展、科技创新和成果转化应用的协调发展。
四、发展目标
总体目标 探索建立符合我省实际和卫生科学发展规律的卫生科技研究体系、创新体系、成果转化应用体系和支撑体系。增强疾病防控的科学技术能力，有效解决卫生工作中的关键问题，促进人口与环境、经济、社会的协调发展。提高基础科研和自主创新能力，使我省卫生科技整体实力达到全国前进水平。在提高我省人口素质、重大疾病防治等方面提供有力的卫生科技支持。
具体目标：到2010年我省人口和人民健康水平得到明显改善；人口出生率控制在12‰以下，人口死亡率控制在5‰以下，人口自然增长率控制在7‰以下；婴儿死亡率下降到8‰以下，出生缺陷率有所下降，孕产妇死亡率下降到15／10万以下；预期寿命不低于75岁。更加有效地控制重大疾病，在传染病大规模流行之前，能掌握病原体在环境中的活动情况；大多数传染病诊断达到实验室确诊水平；遏制艾滋病的上升趋势；慢性非传染性疾病的防治逐步过渡到以早期诊断和预防为主，上升趋势得到合理控制。
加强基础设施建设和人才队伍建设，建立关键技术平台，提升医学科技水平，增强医学科技竞争力，力争增加国家重点学科（实验室）3-5个，全国著名专家（医学院士）2-3人，培养各类学科带头人500名，逐步建立学科、年龄结构合理的卫生科技人才队伍。“十一五”期间，围绕广东全面建设小康社会，率先基本实现社会主义现代化的目标，通过优化布局与结构，多层共建，加大投入，重点建设30个左右重点专科，50个左右特色专科，在全省形成布局合理、技术水平较高、各具优势（特色）的专科点群，扩大覆盖面，缩短服务半径，使人民群众能就近得到较先进的优势医疗卫生保健服务，同时发挥重点专科示范作用。
