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通过近十年的努力，我省卫生科技有较快发展，科技实力明显增强。现承担国家及有关部委的科技项目666项，获资助总额8354万元，是“九五”期初的860万元的9.71倍；全省纳入国家和各部委管理的重点学（专）科65个，其中国家重点实验室2个，国家重点学科14个；博士点207个，硕士点250个；医学院士4人，博士生导师548人。我省的眼科学、肿瘤学、肾病学、神经病学、呼吸病学、消化病学及器官移植技术、微创技术、人类辅助生殖技术在国内处于领先地位。
在总结“九五”期间“五个一科教兴医工程”建设的基础上，我省于2002年开展了广东省医学重点专科、特色专科的建设工作，2003年确定了18个医学重点专科及29个特色专科。通过三年的建设，我省医学专科水平明显提高。共获得立项科技项目327项，资助金额5961万元；各类科技成果奖114项，其中国家级奖励6项，省部级奖励80项；在国外期刊发表论文158篇，国内核心期刊发表论文2361，其中SCI收录212篇；培养研究生500人，博士生298人。
目前，我省卫生科技工作有三大优势，一是国家和社会对卫生科技工作的高度重视；二是二十多年改革开放为卫生科技工作打下了坚实的物质基础；三是培养和引进了大批人才。但我们工作的发展水平仍不能与我省经济和社会的发展相适应，仍不能满足全省人民群众日益增长的卫生需求，在“十一五”期间我们面临着巨大的挑战和难得的发展机遇。
1．人口问题突出。“十一五”期间我省人口仍处于上升阶段，人口总量上升趋势将持续至本世纪中叶。在人口持续增长的同时，人口结构也正在发生明显的变化。据预测，到2020年，我省60岁以上人口将占到总人口的16%，老龄化社会将带来的诸多卫生和社会问题。
2．面临重大传染性疾病的威胁。我省地处国家华南地区，具有特殊的地理和人文特点。由于地处热带亚热带地区，全年平均气温高，温差较小，气候湿热，适于多种传染性疾病的流行和蔓延。一些重大的传染病依旧是威胁我省人民群众健康的主要疾病，艾滋病处于上升趋势，截至2005年底全省累计报告艾滋病病毒感染者13032例，位全国第五位；2002年全省血清流行病学调查显示，乙型肝炎病毒携带者占全省总人口的13.28%；每年发现的传染性结核病患者约2.7万例。另外，传染性非典型肺炎、人禽流感等新发突发的传染性疾病，在危害我省人民群众身体健康与生命安全的同时，严重影响到我省社会和经济的发展。
3．慢性非传染性疾病防治任务繁重。随着经济和社会的发展，疾病谱也在发生变化，慢性非传染性疾病给人民群众和社会带来的疾病负担日益加重。如心脑血管疾病、糖尿病、恶性肿瘤、慢性呼吸道疾病、慢性肝肾疾病等慢性非传染性疾病，占疾病总死亡率的70%以上，是威胁劳动力人群健康的主要疾病。
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